应用实时荧光定量PCR技术分析氧化亚铁硫杆菌ATCC 23270酸激基因的表达差异

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微生物新陈代谢的弹性使得它们能在环境的改变超出它们最佳生长范围时作出反应并且逐渐适应。对于环境压力,比如营养缺乏,气温,盐度和pH值的研究显示,细菌的某些生理机制能让它们在不利的条件下生存下来。每一种细菌都有其适宜的pH生长范围。浸矿细菌是一种产酸又嗜酸的细菌,环境酸度对细菌生长有显著影响。有资料报道:细菌氧化Fe2+的最适pH范围为1.5-2.5。氧化亚铁硫杆菌是冶金工业中最具商业价值的菌种,也是研究最多的菌种之一。一般认为,它的最适宜pH为2.0-3.5。本文研究了不同初始pH对嗜酸氧化亚铁硫杆菌模式菌株(简称A.f)ATCC 23270生长的影响,从而初步了解A.f ATCC 23270在不同初始pH的培养基中的生长情况。研究结果表明A.fATCC 23270生长的初始pH范围很广,可以说从pH=1.3至pH=7.0,细菌都可以生长,培养基初始pH=1.0时,细菌逐渐衰亡。A.f ATCC 23270能够在初始pH=4.0、5.0、6.0、7.0的培养基中生长是因为在接种后很短的时间,培养基的pH值就会降至3.0左右,而一般认为,A.f的最适pH值是2.0-3.5。A.f ATCC 23270在初始pH=1.3的培养基中生长,但是生长受到抑制,菌浓度只能达到其在其它初始pH的培养基中的1/2甚至1/3。为了了解A.f ATCC 23270在低pH培养基中耐酸相关基因的表达情况,本研究应用实时定量PCR技术对A.f ATCC 23270中耐酸相关基因的表达差异进行研究。实时定量PCR技术分析的结果显示,在经受酸激一定时间后(1h、4h、6h),细胞既有普通的转录水平应答也有特异性的应答。这些应答包括了与细胞膜结构、转录调控等作用相关的基因的差异表达,如编码两组分应答调控子OmpR的基因、编码全局调控子Fur的基因以及编码RNA聚合酶sigma-38因子(rpoS)的基因等等。这些结果表明,A.f ATCC 23270通过调节多个细胞膜组分和转录调控子对不断变化的外部pH做出应答。
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