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本文主要是对柳蚕卵黄原蛋白基因cDNA的克隆和序列分析。柳蚕(Actias selene Hubner) 是属于鳞翅目 (Lepidoptera) 大蚕蛾科 (Saturniidae)的一种野生绢丝昆虫,国内外对其相关研究较少。文中通过SDS-PAGE 和 Westernblotting 鉴定了柳蚕的卵黄原蛋白是由大小两个亚基组成,分子量分别为175kD和45kD,存在组织、时期、性别表达的差异性。利用昆虫卵黄原蛋白进化上的保守性,根据已经解析出的家蚕、天蚕、柞蚕、蓖麻蚕、樟蚕、野桑蚕、樗蚕卵黄原蛋白cDNA序列设计4对特异性引物对柳蚕的总RNA进行RT-PCR扩增,分别得到4条大小分别为1000bp、1000bp、2200bp、1700bp左右的cDNA片段;对于3’-end进行RACE扩增,得到了1条750bp左右的cDNA片段,因cDNA片段的重叠性好,从而解析出柳蚕卵黄原蛋白cDNA的全序列。
1.序列含有5701碱基,由一个ORF组成,编码1774个氨基酸,卵黄原蛋白的氨基酸序列和cDNA序列与樟蚕、天蚕、柞蚕、野桑蚕、家蚕、樗蚕、蓖麻蚕的同源性分别为83.1%、81.1%、81.0%、64.7%、64.6%、79.7%、79.2%和82.5%、82.6%、82.7%、60.2%、60.4%、79.8%、79.9%。含有特定的酶切识别位点RSRR,卵黄原蛋白前体被酶切为大小两个亚基,根据氨基酸推算的相对分子质量分别为161.565KD和39.654KD,如果考虑到翻译后的修饰,这与SDS-PAGE 鉴定的结果是吻合的。
2.序列含有两个多聚丝氨酸区,分别在切割位点前14个和后24个氨基酸处,DGQR和GIcG分别出现在第1573和1590氨基酸处,C末端含有6个保守的半胱氨酸。根据已经解析的8种绢丝昆虫卵黄原蛋白的氨基酸序列构建了系统树,结果证明了昆虫卵黄原蛋白的一级结构在进化上具有很好的保守性。柳蚕卵黄原蛋白cDNA序列已登录GeneBank,登录号为EE523567。