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本试验以我国不同海域雌性三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）4个野生群体（来自丹东渔场、莱州湾渔场、海州湾渔场、舟山渔场）为实验材料,分别称为丹东群体,莱州湾群体,海州湾群体以及舟山群体（下同）。采用形态学性状多元分析技术、扩增片段长度多态性（Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP）技术,对三疣梭子蟹的基因多样性进行了研究,对其种质资源的分布及差异状况进行了客观评价,主要结果如下:通过对4个群体的雌性三疣梭子蟹8项生物学形态性状的测量,采用多元分析方法对其进行比较分析。聚类分析结果表明:海州湾群体与舟山群体2个群体形态最为接近,首先聚为一组。丹东群体和莱州湾2个群体形态较为接近聚为另一组。通过对7项形态比例参数单因素方差分析,找到了4个群体间存在显著差异的形态比例参数。2种分析结果均显示,4个群体三疣梭子蟹在形态上已产生一定程度的差异,但所有的差异均未达到亚种水平,需要多项参数综合判别才能将4个群体的三疣梭子蟹区分开来。对4个群体卵径及一期蚤状幼体的单因素方差分析表明,在P＜0.05的水平上,4个群体在卵径上差异并不明显,在P＜0.05的水平上,只有莱州湾与舟山群体的一期蚤状幼体差异显著。对四个群体的产卵量的单因素方差表明,在P＜0.05的置信区间内,丹东群体与舟山群体差异显著,莱州湾群体与海州湾群体及舟山群体差异都显著;在P＜0.01的置信区间内,丹东群体与舟山群体差异极显著,莱州湾群体与舟山群体差异极显著。通过对4个野生群体的三疣梭子蟹8项生物学外部形态性状的测量,定量地分析了形态性状对体重的影响效果。建立了全甲宽（X1）、第一侧齿间距（X2）、甲宽（X3）、甲长（X4）、大螯不动指长（X5）对体重（Y）的回归方程,为三疣梭子蟹育种提供理论依据。采用AFLP技术对三疣梭子蟹4个野生群体进行了遗传分析。每个群体随机取样30个,5对AFLP引物获得115个位点。其中丹东群体多态位点比例(P0.99)43.69%、Shannon多样性指数（H′）0.1501;莱州湾群体多态位点比例(P0.99)44.34%、Shannon多样性指数（H′）0.1577;舟山群体多态位点比例(P0.99)43.93%、Shannon多样性指数（H′）0.1450;海州湾多态位点比例(P0.99)41.35%,Shannon多样性指数（H1′）0.1559。4个群体之间的遗传差异有89.06%是来源于群体内,只有10.94%是来源于群体间。聚类分析表明:4个群体分为两组,丹东群体和莱州湾群体亲缘关系比较近,聚为一组,海州湾群体和舟山两群体之间的亲缘关系最近,聚为另一组。