近年来稻曲病发生日渐增多,已由水稻上的次要病害上升为主要病害之一。稻曲病可造成水稻减产、稻米品质下降、产生毒素危害人畜健康等问题,因此其病原稻曲病菌(Villosiclava virens)亦已成为研究热点。实验表明光照能显著抑制稻曲病菌菌丝的生长,但对于这一抑制作用的分子机理目前尚无相关报道。本研究将稻曲病菌(ZJ09菌株)分别在黑暗和白光条件下培养,采集两组菌丝并利用Illumina高通量测序技术对其进行转录组测序,比较两组菌丝的基因表达情况,获得695个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中359上调,336个下调。选取6个基因用qRT-PCR进行验证,结果与转录组测序的结果一致,证实了转录组数据的可信度及有效度。对DEGs进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析,结果生物过程、细胞成分和分子功能这三大类Term都有DEGs富集,说明光照抑制稻曲病菌菌丝的生长涉及复杂的机理。对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释的结果表明,光照抑制稻曲病菌菌丝的生长可能主要与核糖体的结构与功能,以及氨基酸代谢受到影响有较大关系。具体分析重要DEGs的功能,发现光照显著地影响了稻曲病菌的乙酰辅酶A合成酶基因、一些MAPK信号通路相关基因、一些细胞分裂相关基因、一些致病力相关基因的表达量。根据已有研究,这些关键基因在多种其它真菌的生长发育中起重要作用。而文献报道与稻曲病菌生长有关的基因UvHOG1的表达量,未见受到光照的影响。在白光实验结果的基础上,进一步证实白光中的蓝光和红光对稻曲病菌菌丝的生长都有抑制作用,但蓝光的抑制作用要显著强于红光的抑制作用。克隆了稻曲病菌ZJ09菌株中White Collar-1蛋白基因编码区序列,生物信息学分析表明其蛋白包含感光结构域;进化上与绿僵菌属真菌White Collar-1蛋白的亲缘关系最近。本文的研究结果有助于从分子水平上了解光调控稻曲病菌菌丝生长的机制。