安徽鸡源大肠杆菌多种耐药基因及质粒的流行特征研究

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zlk84
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,细菌耐药性迅速发展,多重耐药菌频繁出现,成为威胁世界公共卫生安全的问题之一。多种耐药基因可通过质粒在不同来源细菌之间广泛传播,对人类和动物的健康造成潜在威胁。食品动物作为耐药菌重要的“储存库”,可将耐药基因通过食物链传播至人。为探究国内食品动物源大肠杆菌中多种重要耐药基因及质粒的流行规律,以及药物使用政策调整对耐药基因流行分布和传播特征的影响,本文对安徽某肉鸡场2013年~2018年分离的大肠杆菌中Inc HI2、Inc FⅡ、Inc I2、Inc I1和Inc X4质粒及bla CTX-M、fos A3、rmt B和mcr-1基因的流行特征进行研究,为动物源细菌耐药性监测及合理用药提供参考依据。本研究以2013年~2018年从安徽某肉鸡场分离的552株大肠杆菌为研究对象,采用PCR方法检测Inc HI2、Inc FⅡ、Inc I2、Inc I1及Inc X4质粒和bla CTX-M-1G、bla CTX-M-9G、fos A3、rmt B和mcr-1等耐药基因,结果显示Inc HI2、Inc FⅡ、Inc I2、Inc I1和Inc X4质粒在大肠杆菌中的检出率分别为32.61%(n=180)、26.63%(n=147)、26.45%(n=146)、6.25%(n=36)和2.54%(n=14)。2013年~2018年,Inc HI2质粒检出率在20.48%至46.67%之间波动,Inc FⅡ质粒检出率从8.70%上升至43.85%,Inc I2质粒检出率则从47.25%下降为19.23%,Inc I1和Inc X4质粒只在2105和2016年检出率较高,其他年份检出率分别低于10%和5%。bla CTX-M、fos A3、rmt B和mcr-1基因的检出率分别为78.8%(n=435)、54.17%(n=299)、20.29%(n=112)和35.68%(n=197)。6年间,bla CTX-M检出率在70%~94%之间波动,fos A3基因检出率从83.52%下降为21.54%,rmt B检出率由6.59%逐渐上升至31.54%,mcr-1基因检出率整体呈下降趋势,2017年~2018年下降尤为明显。采用PCR的方法,对mcr-1基因侧翼进行分析并且确定mcr-1基因位于何种质粒型中。共发现4种不同的基因环境,其中87株菌仅在mcr-1基因上游检测到插入序列ISApl1,23株菌在mcr-1基因上下游均检测到ISApl1,5株菌在mcr-1基因上游检测到完整的ISApl1,下游检测到不完整的ISApl1,114株菌在mcr-1基因上下游均未检测到ISApl1。197株mcr-1阳性菌中有192株mcr-1基因位于Inc HI2、Inc I2和Inc X4质粒上。2017年~2018年,mcr-1-Inc X4逐渐消失,mcr-1-Inc HI2也呈现降低趋势,mcr-1-Inc I2则呈现上升趋势。从197株mcr-1阳性大肠杆菌中挑选不同年份、不同质粒型和不同基因环境的72株进行接合转化实验,获得了61株接合转化子,其中Inc HI2、Inc I2和Inc X4质粒分别为18、38和5株。接合子进行S1-PFGE实验,结果显示所有接合转化子均为单质粒,Inc HI2质粒大小为210.0~310.0 kb之间,Inc I2质粒大小为54.7~78.2 kb之间,Inc X4质粒大小约为33.3 kb。琼脂稀释法检测61株接合/转化子对15种抗菌药的敏感性,黏菌素用微量稀释法检测,结果显示所有接合/转化子黏菌素最小抑菌浓度(Minimum Inhibitory Concentration,MIC)在2~16μg/m L之间,对氨苄西林和头孢噻肟的耐药率高于40%,对磷霉素和氟苯尼考的耐药率在20%~30%之间,对头孢他啶、庆大霉素和新霉素的耐药率在10%~20%之间,对多西环素、四环素和复方新诺明的耐药率均低于10%,61株接合/转化子对头孢西丁、阿米卡星、亚胺培南和环丙沙星均敏感。采用PCR方法检测接合/转化子中其他耐药基因的携带情况,1株Inc X4接合子携带bla CTX-M-14,10株Inc I2质粒携带bla CTX-M-64(n=3)、bla CTX-M-55(n=6)或bla CTX-M-132(n=1),其余Inc X4和Inc I2接合/转化子均不携带其他耐药基因。Inc HI2接合子中有17株同时携带bla CTX-M-14、fos A3和flo R基因,其中分别有4株、3株和1株接合子还携带tet A、oqx AB和bla CTX-M-15,说明Inc HI2质粒中mcr-1常与其他耐药基因共传播,介导多种抗生素耐药。综上所述,该肉鸡场大肠杆菌中多种耐药基因和质粒广泛传播,其中mcr-1基因主要通过Inc HI2、Inc I2、Inc X4质粒在该养殖场中传播,且mcr-1-Inc HI2质粒通常同时携带多种耐药基因。值得关注的是,2017年~2018年mcr-1基因的流行分布和传播特征均发生了显著的变化,这可能与我国自2017年起禁止使用黏菌素作为饲料添加剂有关。因此,我们应规范养殖场中药物的使用,并且加强对细菌耐药性的监测,保障人类的健康及畜牧业的可持续发展。
其他文献
作为一种新型的动物饲料添加剂,那西肽在畜禽和水产养殖业中获得了广泛的应用。然而,不规范使用或过度使用可能导致那西肽在动物源性食品中残留严重,甚至超标,从而对人类的身体健康构成潜在的危害。本研究分别基于分散固相萃取法和碱水解法,建立了高效、灵敏与可靠的测定饲料中那西肽含量和动物组织中那西肽残留的分析方法,为那西肽的分析测定提供了新技术和新手段。建立基于分散固相萃取-高效液相色谱-荧光检测法测定动物饲
生长迟缓这一现象在我国的畜牧生产中比较常见,它会严重影响养殖业的经济效益。目前关于生长迟缓的研究多集中于宫内生长迟缓,对体外生长迟缓研究很少,一般集中在营养和防疫方面。在肉牛上,以分子水平探讨其体外生长迟缓机制的研究基本没有。本研究拟通过高通量测序技术、生物信息学分析等方法,研究在我国华南地区雷琼牛生长正常组和生长迟缓组肝脏中的相关基因及lnc RNA的表达差异,以揭示相关基因及lnc RNA在调
新城疫(Newcastle Disease,ND)是一种由新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)引起禽类发病、致死的急性、高度接触性传染病,主要以感染鸡与火鸡为主。目前新城疫病毒的流行株为基因VII型毒株,尤其是VIId亚型毒株的流行给我国养禽业造成了巨大的经济损失。与传统疫苗相比,DNA疫苗的优势在于其安全性和可诱导产生高水平的细胞免疫和体液免疫,但是由于核酸酶等的
火鸡疱疹病毒(Herpesvirus of turkey,HVT)是一种双链DNA病毒,基因组约为160~180 kb,庞大的基因组为外源基因提供多个插入位点。HVT是细胞结合性疱疹病毒,可在携带有高水平母源抗体的禽类体内繁殖,并可终身感染,可诱导宿主产生细胞免疫和体液免疫。基于以上特性,重组HVT载体疫苗具有成为多联多价疫苗的潜力。2016年中新出现的高致病性H7N9亚型禽流感病毒(Avain
猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)是一种无囊膜结构的单股环状DNA病毒,于2016年被美国学者发现并报道。该病毒对猪的各个发育阶段都易感,尤其对仔猪有很强的感染力与致病力。自报道以来,它已在全球范围内出现。2017年,华中农业大学何启盖教授首次报到了国内PCV3感染病例及其临床症状,发现其和猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type
随着抗菌药在兽医临床的大量使用甚至滥用,动物源细菌耐药性问题日趋严重,亟需开发新型动物专用抗菌药。截短侧耳素是Pleurotus mutilus(Clitopilus scyphoides)和Pleurotus passeckerianus(Clitopilus passeckerianus)产生具有骈合5-6-8三环的二萜类天然产物,对部分革兰式阴性菌、多数阳性菌及支原体有较强的抑菌活性,不易与
随着低蛋白日粮的不断推广,平衡氨基酸(AA)需要的研究也越来越多。而理想氨基酸模式,尤其是氨基酸的合理配比,如精准的蛋氨酸(Met):胱氨酸(Cys)比值,目前尚不清楚。蛋氨酸是必需氨基酸中唯一含硫的氨基酸,同时它也是一种甲基供体,参与动物体内甲基的转移、蛋白质、半胱氨酸、肾上腺素、胆碱和肌酸的合成。本研究选用4周龄昆明小鼠雌雄各24只随机分为三组,分别饲喂Met:Cys比例为1:3的低比例、1:
近年来,广东养猪业的生产规模扩大,发展速度加快,但副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPS)、猪链球菌2型(Streptococcus suis Type 2,SS2)和猪多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)这三种常见的病原体继续对养猪业造成了重大损害,制约着养猪业的健康发展。因此,对HPS、SS2和Pm的流行现状进行研究,建立快捷简便的检测方法
近年来,抗生素临床应用的增加导致多重耐药革兰氏阴性肠杆菌科细菌感染越来越严重。磷霉素虽然自发现至今已有50年的使用历史,但由于其独特的抗菌机理和化学结构,对革兰氏阴性菌和部分革兰氏阳性菌仍具有杀菌活性,且与其他药物具有良好的协同作用。磷霉素作为人医的临床用药,其耐药菌的检出报道近几年在动物源及环境源大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌中有所增加。磷霉素耐药主要由磷霉素耐药基因fos A3介导,fos A3常在
塞尼卡病毒(Senecavirus A,SVA)属于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)Senecavirus病毒属成员,为单股正链不分节的RNA病毒,其临诊特征为病猪鼻镜和蹄部发生水疱、溃烂等,严重者会死亡,该病严重危害养殖业的发展。本研究主要收集广东省里某养殖场的发病猪病料,参照NCBI上公布的SVA序列设计特异引物,采用RT-PCR方法鉴定病料,利用PK-15细胞分离病毒,分离株