耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药基因检测及其基因同源性分析

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tianyq
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目的:1.了解我院2015年1月至2019年12月临床分离的肺炎克雷伯菌(Klebsiella Pneumoniae,KPN)和其中实验室保存的123株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant Klebsiella Pneumoniae,CRKP)的感染特征及耐药谱特点。2.研究我院CRKP的耐药机制,为指导临床合理应用抗菌药物提供实验室依据。3.采用多位点序列分型技术(Multilocus sequence typing,MLST),分析我院CRKP的基因同源性,为及时有效预防和控制CRKP的水平传播提供理论依据。方法:1.利用WHONET5.6软件对我院2015年1月至2019年12月临床分离的1514株KPN和其中实验室保存的123株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌进行临床资料及耐药情况的统计分析;2.采用改良碳青霉烯类失活法(modified carbapenem inactivation method,m CIM)和EDTA碳青霉烯类失活法(EDTA-carbapenem inactivation method,e CIM)或EDTA协同试验进行碳青霉烯酶表型筛选试验;3.通过PCR方法对CRKP四种最常见的碳青霉烯酶耐药基因blaKPC、blaNDM、bla IMP和blaVIM进行特异性扩增,扩增阳性产物经测序、比对,明确碳青霉烯酶基因类型,并与表型试验结果进行比对分析;4.通过PCR方法对CRKP的7个管家基因进行特异性扩增,扩增阳性产物经测序后在巴斯德网站上进行比对获得ST型,并在e BURST软件上进行同源性分析。结果:1.2015年1月-2019年12月共分离出KPN1514例。5年间本院KPN的平均检出率为9.44%,CRKP平均检出率为1.5%。2.近5年检出的1514例KPN来源最多的是痰液,检出717株占47.36%;其次是尿液,检出356株占23.51%;血液检出250株占16.51%;123株CRKP中,来源最多的也是痰液标本,检出75株占60.97%;来自尿液标本21株占17.07%,来自血液标本15株占12.20%;3.近5年从临床科室检出的1514株KPN中位居前4的科室是ICU270株占17.83%,其次是呼吸病房179株占11.82%、神经外科病房138株占9.11%、神经内科病房101株占6.67%;临床科室检出的123株CRKP位居前4的科室依旧是ICU 33株占26.83%、呼吸病房26株占21.14%、神经外科病房20株占16.26%、神经内科病房18株占14.63%。4.近5年检出的KPN对喹诺酮类、头孢类、单环类、四环素类、磺胺类药物的耐药率较高(30%-50%),对碳青霉烯类药物的耐药率相对较低(10%-30%),但均呈逐年上升趋势;123株CRKP对头孢菌素类、酶抑制剂复合制剂、碳青霉烯类等抗菌药物的耐药率达到100%,喹诺酮类、单环类、四环素类中的米诺环素等耐药率也达到95%以上,对氨基糖苷类的耐药率均稍低,但也接近80%以上,对替加环素的耐药率最低4.23%;5.123株临床分离的CRKP患者平均年龄67岁,平均住院时长33天,研究结果显示患者的性别、合并基础疾病、手术、呼吸机/插管及保留尿管/胃管等在治疗有效和治疗无效间均存在明显差异(P<0.05);6.123株CRKP中m CIM试验均阳性,阳性率为100%,其中有5株CRKP的e CIM试验和EDTA协同试验均阳性,阳性率为4.1%;7.123株CRKP有118株检测出blaKPC基因,检出率为95.9%,有5株检测出blaIMP基因,均未检测出blaVIM和blaNDM基因,其中有一株同时检测出blaKPC和blaIMP基因。blaIMP扩增产物电泳阳性后测序结果经BLAST网站上比对后均为IMP-4亚型;8.123株CRKP进行MLST分型所得的ST型有3种,其中以ST11型为主,共117株,占95.1%;其次是ST76型有5株,占4.1%;ST2193型有1株,占0.8%。结论:1.2015年至2019年期间,我院KPN和CRKP的检出率逐年升高,其中CRKP的逐年检出率明显升高,且对多种抗菌药物的耐药率呈明显上升趋势,临床应进一步加强抗生素的合理使用;2.mCIM试验和EDTA协同试验联合检测能够有效筛选产碳青霉烯类酶肺炎克雷伯菌;3.产KPC型碳青霉烯酶和IMP-4型金属酶是我院肺炎克雷伯菌对亚胺培南和美罗培南耐药的主要机制。4.我院广泛传播ST11型的CRKP,ST2193型与ST11型亲缘关系较近,需加强流行病学监控。
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