水环境中微生物多种多样，其中可能包含肠道细菌、寄生虫卵以及病毒之类的致病性微生物，如果人们不慎饮用，将会给人体健康带来极大影响，所以加强水环境微生物检测方面的研究就显得很有必要。传统的水环境微生物检测方法包括平皿计数法、滤膜法、多管发酵法等方法，这些方法在水环境微生物检测中应用已久，并且也得到了很多研究人员的认可。但是这些检测方法往往耗时较长，无法及时反映出水环境微生物现状。相对于新型的水环境微生物检测方法而言，上述水环境微生物检测方法就显得不够高效，不够准确。目前，流式细胞术、ATP检测法、PCR和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术等新型水环境微生物检测方法已经被广泛的应用于实验室微生物检测及其生理生态研究。通过使用这些新型的分析手段，我们可以更好的检测和了解水环境的微生物状况。　　 本研究主要从饮用水以及城市污水两个角度来探索研究新型水环境微生物检测方法的效果。通过使用流式细胞术、ATP检测法、PCR-DGGE技术等手段来分析研究水环境微生物质量。研究内容主要包括水环境活性/非活性细胞含量测定、水环境微生物再生长能力、微生物ATP含量与微生物数量之间的关系、水环境微生物群落结构及其优势菌落分析等。相比于传统水环境微生物检测方法，流式细胞术、ATP检测法、PCR-DGGE等技术不仅可以缩短检测时间，而且可以更准确地区分水中活性细菌和非活性细菌，估算这些微生物的再生能力，并了解水质微生物群落结构。通过这些技术手段，我们可以更好的帮助饮用水供应企业及时掌握各水处理工艺流程的即时微生物质量，更有效地保障饮用水的安全；而在污水处理领域，我们也可以借助上述技术更好的了解污水处理过程中的微生物生长繁殖变化规律，结合分子生物学手段，我们更可以进一步分离其优势菌株，从而提高污水处理效率。