肿瘤代谢相关基因单核苷酸多态性与非小细胞肺癌预后相关性研究及其机制

被引量 : 6次 | 上传用户:isaxu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
据最新流行病学数据显示,肺癌已经成为最为常见的恶性肿瘤,2012年全球肺癌新发病例约180万,占新增癌症病例总数的13%,已成为男性中发病率和死亡率最高的癌症,在女性中发病率排第三位,死亡率排第二位。肺癌中约80%是非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),由于我国肺癌筛查手段不足,难以做到早期诊治,使得75%左右的NSCLC患者发现时已处中晚期,加上肺癌治疗方法不够规范和先进,仅有少数患者可通过手术获益,造成了非小细胞肺癌的5年生存率较低,为此找到有效的分子标志物用于NSCLC患者的早期诊治及预后评估,对于提高肺癌患者的总体生存期具有重要意义。NSCLC治疗的首选方案和最主要的治疗方法是外科手术。为了提高肺癌外科手术的治愈率和患者的生存率,常常需在术前或术后进行辅助化疗、放疗等治疗。晚期NSCLC患者因不能手术或不宜手术,临床上建议采用放疗,放、化疗结合综合治疗也是目前局部晚期NSCLC广泛应用的治疗策略。然而,由于肿瘤异质性的特点,采用同一种治疗方案的不同患者疗效差异显著,为了解决这个问题,个体化医疗的概念被提出,但目前临床中仍缺乏有效的区分不同患者个体差异的标志物,难以有效的区分患者个体差异实施个体化治疗。目前,利用肿瘤细胞与正常细胞在分子、细胞水平差异,针对细胞受体、基因及调控分子等信号传导为药物靶点的分子靶向治疗应用已成为当前肺癌临床应用研究领域的热点,但可以应用到临床实践的标志物仍然很少。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是基因组中由单个碱基变异或短片段插入缺少而引起人群中DNA序列的多态性,变异在人群中达到一定频率(大于1%)。随着SNP研究的深入,已发现多个癌基因或抑癌基因中SNP与包括肿瘤在内多种疾病发生、发展密切相关,另有SNP也可用于肿瘤化疗疗效评估。在NSCLC中已发现部分与患者预后密切相关的SNP,但数目较少,且利用单个位点进行评估时效果有限,为此寻找更多的可用于NSCLC预后评估的SNP位点,制定联合分析策略,在NSCLC个体化治疗中具有重要意义。代谢异常是肿瘤重要特征之一,早在20世纪30年代,生物化学家Otto Warburg就发现即使在氧供充分的条件下肿瘤细胞依然保持旺盛的糖酵解,消耗大量葡萄糖。陆续研究发现肿瘤代谢重编程与肿瘤进展密切相关。目前,肿瘤中已发现多条代谢通路发生改变包括糖代谢、核苷酸代谢、线粒体能量代谢等影响生命活动的重要代谢通路。对于这些通路中关键基因的研究,寻找肿瘤特异的标志物,有利于NSCLC临床个体化治疗开展。目的:本研究以代谢通路关键基因为目标,寻找并证实与NSCLC患者预后密切相关的SNP标志物,为临床个体化治疗提供更多策略。方法:入组病例来自第四军医大学唐都医院胸外科,经过剔除后最终入组500例NSCLC患者进行研究。通过SEQUENOM Mass Array基因质谱仪对上述样本中代谢物转运基因、三羧酸循环通路关键基因、糖代谢相关基因、核苷酸合成代谢基因共计15个基因43个SNP位点进行基因分型检测,并结合患者临床信息,采用Cox比例风险回归模型、Kaplan-Meier法、Log-rank秩和检验、生存树分析等多种统计方法分析SNP不同基因型与NSCLC患者预后之间的相关性,并利用TCGA公共数据进行基因差异表达和拷贝数分析。结果:研究发现,在NSCLC中代谢物转运相关基因CD98 SNP位点rs1059292WV+VV型患者与WW型患者相比,死亡风险显著升高,并且rs1059292 WV+VV型患者与WW型患者相比,促进肿瘤生长以及淋巴结转移,该位点突变型可促进CD98基因转录增强。另一个基因MCT1 SNP位点rs1049434突变型患者与野性型患者相比死亡、复发风险均显著降低,MCT2基因SNP位点rs995343 VV型患者与WW+WV型患者相比死亡风险升高。还发现三羧酸循环通路关键酶基因SDHC SNP位点rs12064957 WV+VV型NSCLC患者与WW型患者相比,死亡风险显著降低。IDH2基因SNP位点rs11540478在Additive模型下,突变型患者死亡风险显著升高。另外,FH基因rs1414493位点WV+VV型患者与WW型患者相比,死亡风险显著升高。生存树分析发现rs1414493位点对患者死亡影响最大,rs4932158对患者复发影响最大。NSCLC患者中糖代谢相关基因GPI 2个SNP位点rs7248411,rs8191356 VV型患者与WW+WV患者相比死亡、复发风险均显著降低。2个SNP位点基因型进行累积效应分析发现危险基因型对患者死亡、复发风险随危险基因型个数增加而具有递增趋势。用肿瘤分化级别、TNM分期分层后GPI基因2个SNP位点仍与患者预后密切相关。核苷酸合成代谢基因TYMS SNP位点rs2847153 VV型NSCLC患者与WW+WV患者相比复发风险显著升高。rs2847153 WW+WV型患者中,术后化疗患者与未化疗患者相比死亡、复发风险均显著下降。另一个核苷酸代谢基因RRM2B SNP位点rs2290707和rs2853231 VV型患者与WW+WV患者相比复发风险均显著降低。结论:①代谢物转运基因CD98、MCT1、MCT2中rs1059292、rs1049434、rs995343可用于NSCLC患者预后评估;②三羧酸循环通路基因中rs12064957、rs11540478、rs1414493等位点或可作为NSCLC患者早期预后不良的重要指标;③糖代谢相关基因GPI中rs7248411,rs8191356不同基因型与NSCLC患者预后密切相关;④核苷酸代谢基因TYMS、RRM2B中rs2847153、rs2290707和rs2853231位点可作为NSCLC患者预后评判的指导依据。
其他文献
企业的内部控制是提高企业经营效率、降低运行风险的重要措施和手段,因此内部控制的设计必须和企业的长远发展战略相协调和匹配,而内部控制的有效性是其真正发挥效用的重要体
自交际能力概念问世以来,众多学者从不同角度对它进行了研究。通过评析Hymes、Canale&Swain和Bachman三个人的交际能力理论可以认为,交际能力应包括认知理解能力,同时应把语
信息技术的影响业已深入扩展到人类社会结构中的各个方面,而基础教育信息技术课程中的目标定位并没有集中深度的体现。本研究通过对不同视域下的信息技术课程目标以及已有的
二十世纪八十年代后,越来越多的非安格鲁撒克逊后裔的美国人登上美国戏剧舞台。多元文化运动让族裔戏剧成为热门话题和戏剧学习的焦点。同性恋戏剧同样备受关注。美国华裔剧
本文应用联合异速生长尺度模型对4939尾牙鲆的多个形态性状对体质量或体长的异速生长进行了遗传分析。结果表明:形态性状相对体质量的异速生长的遗传力从0.251到0.755不等;而
课后课是韩国汉语教学的重要模式之一,据笔者统计,2014年48名任教于韩国小学的志愿者,教授课后课的有34名,比例高达71%。笔者于2014年2月-2015年1月在罗州小学进行了为期一年
在高铁线路和高原线路上,由于区间里程长、环境恶劣等原因造成人工探伤作业困难,主要采用钢轨探伤车进行探伤。在《钢轨探伤管理规则》(铁运[2006]200号)和《钢轨探伤车运用
本文论述了在滑坡地质勘察中,测斜仪的应用,通过测斜仪监测的数据,来分析滑坡的动态变化,并对测斜仪测得的数据误差进行综合分析。
为研究脊尾白虾蜕皮抑制激素基因(mih)在卵巢和幼体发育中的作用,本文采用RACE技术从蜕皮间期脊尾白虾眼柄中克隆获得MIH-like基因全长1218bp的c DNA序列,开放阅读框编码120
<正>1.前言目前关于体育经济学的学科属性问题,有着不同的看法和意见,虽各有道理,但其性质差异决定了体育经济学科的发展方向和进程,作为其重要组成部分体育产业研究也深受影
会议