全要素生产率是经济增长的关键因素,通过增加研发投入来提升全要素生产率,进而推动经济增长的观点已被广泛接受。研发投入是创新的主要来源,已成为从企业生产到国家战略的重要组成部分,更是我国经济从高速发展到高质量发展转型的重要环节。本文基于我国目前经济发展背景和已有研究,从研发投入与全要素生产率的关系入手,根据1999-2013年我国30个省市(除西藏,港澳台外)的工业层面的统计数据,采用DEA-Malmquist指数对全要素生产率进行估算,以内生性增长理论为基础,通过建立实证模型,对全国以及东、中、西部地区进行分析,并就回归结果作对比。结果表明:首先,我们发现研发投入对我国全要素生产率有显著的正向影响,当其他变量保持不变时,研发投入每增加一个百分点,全要素生产率就会随之增加0.3183%。全要素生产率还受到市场化水平、人力资本和产业结构的影响,其中产业结构在10%的显著水平下正相关,若我国第二产业所占的比重能持续提升,经济体将实现更快地增长。外商直接投资具有不显著的负向影响,表明我国企业还是无法直接对技术进行合理的使用和吸收。所有制结构与全要素生产率具有负相关关系,表明国有资本所占比重越大越阻碍全要素生产率的提升;其次,在分地区的回归结果中,各地区模型中解释变量研发投入的系数均为正,其中东部和中部地区的研发投入变量表现显著,西部地区不显著。只有中部以及东部地区的生产率会受到自主研发的正面影响。同时,也只有西部地区的生产率会受到国外技术引进的正面影响。本文最后根据所得结论提出一些具有针对性的政策和建议。关于研发投入力度方面:要增强对于基础研究和应用研究方面的研发投入力度。加大对人力资本要素方面的投资,消除制度性壁垒促进人才跨区域流动,充分发挥人力资本和研发资本在市场中的流动导致的再配置效应。关于研发投入效率方面:先要强化企业的创新意识和创新能力,提升企业自身核心竞争力。增强企业研发主体地位,建立“产学研”协调合作发展的创新体系,通过创新因素的空间集聚效应加速研究和科研成果的发展。以及通过各种途径来提升我国各行业的技术成果转化率,如知识产权激励机制和科技研发资金监督管理机制。最后对于研发投入配置方面:要调整优化研发投入结构,设立符合市场导向的企业成长机制和运行机制。实施积极的财政政策有效提升全要素生产率的增长。有必要推行市场化使生产发展迈上新台阶。