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对引自澳大利亚昆士兰洲北部大部分分布区的巨桉11个种源20个家系采用改良的CTAB法提取了80个植株叶片的基因组DNA，应用RAPD分子标记检测基因组DNA水平的遗传结构和遗传多样性。从186个10bp随机引物中筛选了20个随机引物用于基因组DNA扩增，共获得了201个扩增标记位点，其中89个为多态性RAPD标记，占44.28％。在RAPD多态性基础上研究基因组DNA多态位点百分率P（Proporation of polymorphicloci）、遗传分化指数DC（Diversity coefficient）、遗传分化比率PDC（Proportion of diversity coefficient）和Nei’s无偏差遗传一致度I（Unbiasedgenetic identity）及无偏差遗传距离D（Unbiased estimates of geneticdistence）。几个分析指标均表明：11个巨桉种源在DNA水平存在着丰富的遗传多样性，遗传结构复杂；其中遗传多样性水平最高的是18591种源其多态位点百分率P达39.5％，其次是18594种源其多态位点百分率P达36.7％；巨桉种源内遗传多样性丰富，种源间的差异较小，平均DC值为0.6154，平均PDC值为7.27％，平均遗传距离为0.1664。采用不同的参数指标对巨桉11个种源的聚类结果表明：种源间遗传关系密切。18180，18591，18595，17562，18590，18592，18594遗传相似性水平高，17857与其他种源遗传相似性水平低。同时也讨论了两种种群分析方法的差异。巨桉不同种源群体DNA水平的遗传多样性研究为巨桉种源试验中的早期选择提供了科学依据。