LncRNA LINC01614在胃癌中的表达及对胃癌细胞生物学行为的影响

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:e1r2s3
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探索长链非编码RNA LINC01614在胃癌组织和细胞中的表达,研究LINC01614对胃癌细胞生物学行为的影响。方法:1.实时荧光定量PCR鉴定配对的胃癌组织和癌旁组织中lnc RNA LINC01614的表达,以及LINC01614在胃癌细胞和正常胃黏膜上皮细胞中的表达。2.对LINC01614进行生物信息学分析和功能预测。利用癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas Program,TCGA)和Gene expression omnibus(GEO)鉴定LINC01614在胃癌组织和癌旁组织的表达,随后利用TCGA数据库的患者临床数据,分析LINC01614与临床、病理特征的相关性。根据患者的临床生存信息,进一步分析长链非编码RNALINC01614表达与患者生存预后的关系。通过下载得到的TCGA-STAD数据,预测LINC01614的共表达基因,并进行通路富集,从而了解LINC01614在胃癌中的生物学功能及其可能参与的通路。3.利用RNAi干扰LINC01614的表达,建立相应的细胞模型:实验组(LINC01614下调组)和对照组。实验组中利用胃癌细胞MGC-803和胃癌细胞AGS转染si-LINC01614-1和si-LINC01614-2,而对照组则为MGC-803细胞和AGS细胞转染si-NC。并对各个组别的细胞进行PCR检测,鉴定LINC01614的表达。4.利用慢病毒转染SGC-7901细胞,构建并鉴定过表达LINC01614的稳转细胞株SGC-7901-LINC01614和对照组SGC-7901-NC细胞,随后利用PCR鉴定相应细胞中的LINC01614的表达。5.利用CCK-8实验以及细胞集落形成实验,研究敲低LINC01614表达对胃癌细胞增殖的影响。6.利用细胞划痕实验和Transwell实验,研究敲低LINC01614表达对胃癌细胞迁移及侵袭的影响。7.运用流式细胞术检测敲低LINC01614和过表达LINC01614对细胞周期分布和凋亡情况的影响。结果:1.实验结果发现,在22对配对胃癌组织和癌旁组织样品中,20对胃癌组织中LINC01614的相对表达较配对的癌旁组织出现上调,且两组中LINC01614的表达差异存在统计学意义(P<0.0001)。2.对TCGA-STAD数据集进行下载和分析,发现LINC01614的表达在27对配对的胃癌组织和癌旁组织中存在差异,而在非配对的样品中,胃癌组织中的LINC01614表达同样较癌旁组织出现升高(P<0.05)。而根据对GEO数据库数据集GSE95667进行分析发现,胃癌组织中的LINC01614表达同样出现上调,其相对癌旁组织的log2差异倍数为1.953(P0.05),与T分期(P=0.00187)、组织学分级(P=0.0177)、残余癌(P=0.0218)相关;高表达LINC01614的胃癌患者对应较高级别的T分期(P<0.001)、组织学分级(P<0.01)和残余癌(P<0.001)。基于LINC01614潜在的靶向mRNA,根据细胞本体论,LINC01614富集到包括细胞外基质、中性粒细胞激活、生长因子结合等通路(P<0.05)。而在KEGG通路富集分析中,LINC01614潜在靶基因同样富集到已被广泛证实与胃癌发生发展相关的通路,如PI3K-Akt信号通路、细胞周期、TGF-b信号通路(P<0.05)。3.利用si-LINC01614-1和si-LINC01614-2敲低LINC01614表达,胃癌细胞MGC-803和AGS的增殖、迁移、侵袭能力较对照组细胞出现抑制(P<0.05)。同时,干扰LINC01614表达,可使细胞周期阻滞在G2/M期(P0.05)。4.过表达LINC01614的SGC-7901-LINC01614细胞和对照组SGC-7901-NC细胞相比,SGC-7901-LINC01614相对对照组SGC-7901-NC处于G2/M期的减少(P0.05)。结论:长链非编码RNA LINC01614在胃癌组织和细胞中的表达上调,其表达与胃癌患者不良预后相关。LINC01614可作为癌基因参与胃癌发生发展。
其他文献
目的:端粒长度被认为是衰老的生物标志物和年龄相关疾病的危险因素,与心血管疾病、糖尿病、癌症的发生发展有关。随着年龄的增长,端粒逐渐缩短是不可避免的,端粒缩短率可能受到饮食模式、体育锻炼和重金属暴露等多种可变因素的影响。由于采矿和冶炼活动,大量重金属被释放到环境中,重金属暴露,特别是那些引起氧化应激的金属,已被发现与端粒长度有关。既往研究成果更多集中在单一金属暴露对健康的损害效应,然而环境中金属往往
目的:肝静脉闭塞病(Hepatic Veno-occlusive disease,VOD),又称肝静脉闭塞综合症(Sinusoidal obstruction syndrome,SOS),是造血干细胞移植(Hematopoietic stm cell transplantation,HSCT)后严重的并发症之一。本课题对我院521例重型地中海贫血(Thalassemia major,TM)患者接受
研究背景:骨质疏松属于溶骨性骨疾病,其特征是破骨细胞的骨吸收功能增强。有许多种细胞可以促进骨骼形成,但是破骨细胞是可以进行骨吸收的独特细胞。目前,有多种药物用于预防和治疗骨质疏松。但是,由于这些药物的副作用强或疗效一般等原因,亟需开发出新的潜在性抗骨质疏松药物。中草药单体是天然的活性成分,其中大多数类黄酮成分是有抗炎的作用效果,而且还有来源广泛、价格低、毒副作用等特点,逐渐成为了研究骨质疏松防治药
目的:通过对比分析侧前方腹膜外入路与后路病灶清除、椎体间植骨内固定治疗单节段腰椎结核的治疗效果,评价此两种手术入路的安全性及有效性,从而为腰椎结核的手术入路选择提供参考。方法:搜集从2015年3月至2019年5月在广西医科大学第一附属医院行手术治疗的42例单节段腰椎结核的患者的临床资料,根据手术入路的不同分成经侧前方腹膜外入路组(A组)和后路组(B组),其中A组病例数为23例,B组为19例。应用统
目的:以醋酸铅诱导海马神经元凋亡为模型,观察铅对IP3R、Ca2+、ASK1-JNK/p38信号通路的影响,探讨对氨基水杨酸钠(PAS-Na)对铅致海马神经元凋亡的干预作用,为应用PAS-Na治疗铅中毒提供科学依据。方法:取出生24小时内的SD大鼠分离出海马,体外培养原代海马神经元,并进行神经元鉴定。体外培养海马神经元经不同浓度的醋酸铅溶液染毒24小时后,经CCK8法测定神经元存活率,Hoechs
目的:目前,癌细胞中微量元素的调控与乏氧通路的关系仍未明了。本研究旨在探索肝癌患者乏氧反应通路关键调控蛋白HIF-1α(乏氧诱导因子-1α)、调控细胞内锰含量的蛋白SLC30A10(溶质载体家族30成员10)、以锰元素为必需活性中心成分的SOD2(超氧化物歧化酶2)以及受氧浓度调节的乏氧反应元件PHD2(脯氨酸羟化酶2)的表达及其与临床病理特征的关系,以利于寻找潜在的治疗靶点。方法:共收集76例健
目的:筛选并鉴定靶向调控膀胱癌RhoGDI2基因的miRNA。方法:首先通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载膀胱癌的基因表达和miRNA测序数据以及甲基化数据,在线网站预测和RhoGDI2具有结合位点的miRNA。然后使用TCGA数据库的膀胱癌数据分别进行miRNA-m RNA和甲基化-m RNA的关联分析,找出RhoGDI2可能的调控方式;构建带有RhoGDI
目的:探究高尿酸血症(hyperuricemia)对脓毒症(sepsis)患者发生急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的影响。方法:采用回顾性队列研究方法,分析高尿酸血症对脓毒症患者发生AKI的影响。收集459例连续入住重症监护病房(intensive care unit,ICU)的成年脓毒症患者的临床资料,根据患者入住ICU后24小时内首次血清尿酸水平将患者分为高尿酸血症
背景:膝关节前交叉韧带(anterior cruciate ligament,ACL)损伤是以关节镜下重建治疗为主的观念已取得共识。既往常清除ACL残端的目的是保障术野、解剖位置的明晰。由于保留残端重建手术难度大,不容易暴露骨性标志会造成骨道定位偏差,可能增加术后并发症的发生率。是否使用保留残端的ACL重建一直存在争议。目的:通过二次关节镜镜检及术前术后膝关节功能评分来评价前交叉韧带(anteri
目的:通过利用生物信息学方法,探究心房颤动发生与维持过程中的差异基因或信号通路的改变。方法:根据纳入排除标准从基因表达数据库(GEO)中获取与心房颤动相关的基因表达芯片数据集GSE41177、GSE108660和GSE128188,根据组织来源分为左心耳(LAA)房颤芯片数据集和右心耳(RAA)房颤芯片数据集,通过R语言分别分析得到差异表达基因(DEGs),再依次进行功能富集分析、通路富集分析、相