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随着测序技术的发展,RNA-Seq技术越来越受欢迎。利用RNA-Seq技术分析免疫组库的方法具有样本需求量少、操作简单、信息量全面等优势。本论文利用RNA-Seq数据分别对实体瘤和血液病两种类型的癌症的免疫组库进行分析与比较。通过对结肠癌、肺癌、胰腺癌和胃癌这四种实体瘤癌症的癌组织和正常组织的TCR和BCR进行比较分析,发现TCR在各类型癌症间的整体情况基本相似。BCR的多样性在癌组织与正常组织之间、不同癌症类型之间的差异较大,可能成为疾病预测的一种指标。在浸润到癌组织与正常组织的TCR和BCR中,我们发现这些序列都是经过阳性选择的,并且浸润到组织中的TRB序列有20%-30%与正常人外周血TRB库序列相同。我们还发现TRB的异质性程度为:不同癌症类型>同种癌症不同个体>同一个体癌症组织与正常组织。此外,通过PDCD1、TIM-3、LAG3、BTLA和4-1BB五种免疫检查点基因表达量与TCR克隆个数进行相关性分析。发现癌症种类不同,与TCR克隆个数具有相关性的免疫检查点也不相同。通过对B-ALL和正常人外周血样本RNA-Seq数据中BCR受体序列的特征分析。发现B-ALL相对于正常人由于B细胞的克隆性扩增程度增加而造成了 BCR多样性降低。IGH克隆频率ROC曲线的AUC达到了0.944。在筛选出来的高频克隆中,很大一部分IGH都是没有发生体细胞超突变的且CDR3区无功能。此外,B-ALL样本的IGHV基因的使用情况和IGH的CDR3区氨基酸长度分布与正常样本也存在很大差异,可能会成为诊断B-ALL的潜在指标。在本论文中,我们对免疫组库的分析不仅仅局限于TCR,还对组织内部浸润的BCR进行了分析,使得我们对肿瘤内部免疫情况的分析更加全面。我们通过对癌症样本组和正常样本组TCR、BCR受体序列的详细分析,找出了两组样本间免疫组库的联系与差异,从而达到疾病的预测、诊断和追踪的目的,为肿瘤个性化治疗提供了新的思路和依据。