在现实经济生活中，出于各种经营管理目的的需要，企业集团中的母公司进行多种投资及集团企业之间的股权交易，形成了集团内复杂多样的股权结构。合并财务报表一直是会计界公认的难题之一，它是个复杂的会计操作性难题。在传统手工的环境下，合并报表采用的是并表法。随着计算机网络技术的不断发展，越来越多的母、子公司通过计算机网络共同处理各种业务，并且实现母公司对子公司的控制，这已成为了一种趋势。因为母子公司所有业务信息、会计信息都在网络上，只要对这些信息进行一定的加工处理，母子公司合并的会计信息会自然而然地产生出来。因此，本文提出了采用并账法实现复杂股权结构下合并报表的编制。　　 本文主要阐述复杂股权结构下传统的手工编制模式、并表法的电算化编制模式和并账法的电算化编制模式的编制流程，并进行对比。通过具体分析复杂股权结构下采用并账法编制合并财务报表时需要进行的抵消处理的交易，企业合并达到控制权后当期和连续各期内部交易抵消分录等分类进行理论分析和列表区分，使并账法的编制方法具体化，指出其比并表法更适合于合并财务报表的信息系统实现。针对复杂股权结构下并账法的合并财务报表系统的系统功能模块、数据库结构以及处理流程等进行了分析建模。　　 本文的主要研究成果在于从合并报表的思想着眼，将新颁布的企业会计准则引入其中，围绕着复杂股权结构下并账法合并报表抵消分录的处理展开探索性的研究，阐明了并账法合并报表的分析建模和系统设计，以达到对我国财务软件产品的合并设计思路有一定的指导意义。