目的:通过比较慢性脑缺血与急性脑梗死患者单核苷酸多态性(SNP)差异,揭示脑卒中发病与未发病过程中可能存在的差异,为慢性脑缺血进展为急性脑梗死高危患者的风险预测及早期干预提供实验依据。方法:纳入2018年3月至2019年3月就诊于我院神经内科门诊及住院部的慢性脑缺血患者37例(其中男性15例)及急性脑梗死患者46例(其中男性30例);采用EDTA抗凝管收集所有患者空腹静脉血3-4ml,提取DNA;采用illumina公司Infinium HTS基因芯片对两组患者进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS);并对两组患者年龄、性别、吸烟饮酒史、血压、血脂、血糖等一般情况、临床表现、影像学检查结果及GWAS分析结果进行统计学分析。结果:1)两组患者性别组成,差异有统计学意义(p=0.025);年龄、吸烟饮酒史、血压、血脂、血糖等一般情况,差异无统计学意义(p>0.05);2)慢性脑缺血患者临床表现自觉症状多表现为头晕(18/37),余还可出现头痛、记忆力下降、颅鸣、睡眠障碍等表现,且症状多持续3-6月(19/37),少数患者症状持续2年以上就医;急性脑梗死患者均表现为突发偏侧肢体无力、言语障碍、口角歪斜、感觉障碍等;3)慢性脑缺血患者头颅影像学(CT/MRI)异常病灶多位于半卵圆中心、侧脑室旁、基底节区及额叶(缺血灶,尚未发生梗死);急性脑梗死患者头颅影像学异常病灶多位于侧脑室旁、基底节区、大脑皮层、脑干甚至多部位梗死。4)慢性脑缺血组与急性脑梗死组差异SNP位点分析结果显示两组患者SNP位点无显著差异;慢性脑缺血女性与男性患者比较,发现有26个差异SNP位点(p<0.05),分布于1、2、3、12、15、19、23号染色体上,其中5个位点差异显著(p<0.001),均位于23号染色体上;急性脑梗死女性与男性患者比较,发现有35个差异SNP位点(p<0.05),分布于1、2、3、12、15、19、23号染色体上,其中7个位点差异显著(p<0.001),均位于23号染色体上,与慢性脑缺血患者性别差异SNP位点染色体分布一致;5)差异SNP位点对应的差异基因分别为RFTN1、ARSF、PPP1R12B、ALG10B、PCDH11X;其中PCDH11X为急性脑梗死特有差异基因,RFTN1、ARSF、PPP1R12B、ALG10B为慢性脑缺血与急性脑梗死共有差异基因。结论:脑血管疾病发病具有性别差异;单核苷酸多态性可能为慢性脑缺血与急性缺血性脑卒中的遗传学影响因素,经分析两组患者RFTN1、ARSF、PPP1R12B、ALG10B、PCDH11X基因具有差异性,其与性别具有相关性,可作为后续研究慢性脑缺血与急性脑梗死关系的候选基因,成为严重脑血管疾病的早期预警以及不同性别群体脑血管疾病发病情况预测,为严重脑血管疾病提供风险预测及防治目标。