柿及其近缘种亲缘关系及柿品种遗传多样性的研究

来源 :中国林业科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangjunshisb
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柿(Diospyros kaki Thunb.)为柿科(Ebenaceae)柿属(Diospyros Linn.)植物,是我国重要的经济林树种,有铁杆庄稼之称。绝大多数柿品种为六倍体(2n=6X=90),少数为九倍体(2n=9X=135)。我国是柿属植物的分布和原产中心之一,拥有丰富的种质资源,为柿属种质资源的起源进化、亲缘关系以及遗传多样性等研究提供丰富的研究材料,但针对我国整个柿属植物亲缘关系的研究却鲜有报道。虽然前人对柿及其近缘种亲缘关系的研究较多,但结果不完全一致,柿及其近缘种的亲缘关系至今尚不清楚。为分析我国柿属植物的系统进化关系和弄清楚柿及其近缘种间的亲缘关系,本文以17种柿属植物资源为研究对象,利用叶绿体DNA(cp DNA)trn Q-rps16序列分析17种柿属植物的起源进化关系,然后采用限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和ITS、ndh A序列对所选柿及其近缘种进行分析,以更准确确定柿及其近缘种的亲缘关系。此外,本研究还对93份柿品种ITS序列进行序列分析,并依据品种间差异位点对柿品种资源进行遗传差异分析。主要研究结果如下:1.以17种柿属植物共19份资源为试材,分析其叶绿体trn Q-rps16序列变异特征,并通过j Model Test 2.1.5软件计算碱基进化模型,依据进化模型采用最大简约法(MP)和最大似然法(ML)对19份试材进行系统发育分析。结果表明:19份柿属植物分成了两大分支,第一分支为柿及其近缘的9个种,第二分支为其余8个种。根据此次研究对柿及其近缘种分支进行分析得出,第一分支中与柿近缘的8个种中,象牙柿与茎花柿与其余近缘种亲缘关系也较远,故后续关于柿及其近缘种亲缘关系的研究中选择云南野毛柿、油柿、君迁子、浙江柿、金枣柿和美洲柿作为柿的近缘种研究,而乌柿则作为柿及其近缘种的外类群进行研究。2.利用5对cp DNA特异引物和7种限制性内切酶共35对引物/酶组合对柿及其近缘种进行PCR-RFLP进行分析,结果表明:供试柿种质资源存在丰富的种间多态性,但供试22个柿种内品种未检测到变异位点。应用NTSYS中UPGMA法聚类和主坐标分析均表明:柿与金枣柿最近缘,其次分别是油柿、云南野毛柿、浙江柿和君迁子,而与美洲柿和乌柿相距较远。野柿(浙江)作为柿的一个变种,聚类结果也表明野柿(浙江)与柿有一定差异。研究表明:柿品种内仅ndh A条带有微小种内差异,可进一步对ndh A进行测序研究。此外,由于叶绿体DNA相当保守,也可利用核基因ITS进行测序研究。3.利用ITS和ndh A序列变异分析8种共102个基因型的亲缘关系和种内遗传差异,并通过计算两个序列及合并后的进化模型,依据进化模型采用ML法分析其进化关系。结果表明:(1)综合ITS和ndh A序列进化树分析表明:柿与油柿和云南野毛柿亲缘关系最近,之后分别是金枣柿,君迁子和浙江柿,与美洲柿和乌柿最远。(2)93份柿品种材料的ITS长度均为730,包括8个变异位点,据此8个变异位点可将供试柿种内93个品种聚成16个类型,而ndh A序列在柿种内品种间则无差异位点存在。研究认为,ndh A和ITS能较清楚解释了柿与其近缘种间的亲缘关系,并通过柿品种ITS的8个差异位点分析鉴别出栽培柿种内的遗传差异。
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