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本课题对基因工程菌生物强化活性污泥反应器和MBR反应器处理阿特拉津进行了研究，对比基因工程菌生物强化对两种反应器运行的作用；使用FISH技术分析各阶段污泥中硝化菌群生长状态以及降解阿特拉津基因（atzA基因）在基因工程菌和土著菌株之间的转移情况；应用PCR-DGGE技术对比两种反应器不同运行阶段活性污泥中微生物群落的变化；对活性污泥中的土著降解细菌进行提纯鉴定；研究活性污泥对基因工程菌的吸附特性。结果表明，基因工程菌生物强化实现了阿特拉津的高效生物去除效果。阿特拉津的毒性使活性污泥中的生物对常规污染物COD和氨氮的去除活性具有一定的抑制影响；在基因工程菌生物强化作用下，常规污染物的去除效率得到恢复。MBR对污染物的去除性能优于CAS。接种基因工程菌后，阿特拉津降解基因平均相对丰度先减小后增加，表明经过反应器的长期运行，atzA基因不仅存在于基因工程菌中，也转移至土著细菌细胞中。MBR和CAS反应器活性污泥微生物群落在不同的反应器运行阶段具有一定差异。污泥微生物群落的种群多样性和稳定性由于阿特拉津的存在而降低，但经过生物强化去除阿特拉津后使得污泥微生物群落的种群多样性和稳定性有所恢复。MBR反应器对于保持污泥微生物群落的种群多样性和稳定性具有一定的工艺优势。污泥絮体对基因工程菌吸附受污泥性质的影响。污泥浓度增大，吸附能力减小；污泥粒径减小，吸附能力增加；污泥EPS含量越高，吸附能力越强。同时，普通活性污泥吸附能力大于MBR污泥。污泥有机质含量比污泥粒径对基因工程菌吸附的影响更显著。在接种密度为1051014CFU/mL时，普通活性污泥和MBR污泥对基因工程菌的吸附基本符合Freundlich等温吸附方程。从生物强化反应器污泥中分离筛选出3株土著降解菌株WY-A、WY-C和WY-E。菌株WY-A菌落为乳白色圆形，细胞为球状，属于葡萄球菌属；菌株WY-C，菌落为淡粉色圆形，细胞为球状，属于葡萄球属；菌株WY-E，菌落呈粉色圆形，细胞为球状，属于葡萄球菌属。