本文以56家在深圳中小板上市的苏南民营上市公司为样本,选取样本公司2011-2015年的相关数据,实证分析特定历史文化背景下苏南中小板民营企业治理结构对内部控制缺陷的影响。首先,本文回顾和梳理了国内外有关公司治理和内部控制缺陷及两者之间关系的研究,对公司治理和内部控制缺陷的概念进行界定,并基于委托代理理论、信息不对称理论分析公司治理结构对内部控制缺陷的作用机理。其次,分析苏南民营企业所处的社会文化背景和发展历程,剖析苏南中小板民营企业治理结构特点和内部控制现状。接着,结合苏南中小板民营企业特点,从股权结构、董事会、监事会和经理层四个方面探究公司治理对内部控制缺陷的影响,提出研究假设。最后采用二元Logistic回归的方法检验公司治理变量对内部控制缺陷的影响,基于研究结果,提出相应建议。本研究主要得出以下结论:在公司治理方面,苏南中小板民营企业存在股权集中程度高、股东与管理层高度统一、董事长拥有政治背景、股票期权激励不足等特点;在内部控制方面,表现为内部治理环境薄弱、家族色彩浓厚、职业经理人不受重视、内部控制报告披露流于形式等特点;在公司治理与内部控制缺陷的关系上,苏南中小板民营企业股权集中度、机构投资者持股比例、财务背景独立董事占比、高管股票期权激励均能降低内部控制缺陷,董事会规模扩大会增加内部控制缺陷;两职合一、董事长政治背景、高管薪酬则对内部控制缺陷不存在显著影响。