在科研管理领域引入知识管理的理念，指导构建高校的科研管理信息系统，并对知识管理进行跨学科的理论探讨，是一个新颖而又有现实意义的研究课题。依据全息结构分析，可以将高校科研管理知识系统分为知识生产子系统、知识传播子系统和知识应用子系统。以此为理论根据，高校科研管理信息系统的基础功能体系可以划分为知识生产管理子系统、知识传播管理子系统和知识应用管理子系统。各子系统之间只有相互协调，系统整体才能发挥最佳效能。针对传统高校科研管理信息系统所存在的薄弱环节，必须充分注意和加强知识传播管理子系统和知识应用管理子系统的建设。 面向知识管理的高校科研管理信息系统更强调知识的创生、存储、共享和应用在科研管理中的地位，强调隐性知识的作用。在功能上，面向知识管理的高校看管理信息系统增加了协同工作的部分功能；在知识体系结构上，也因此增加了相应部分的知识库和数据库。为了满足知识在组织内部的共享，系统采用B／S模式与C／S模式相结合的网络体系结构，力求避免发生“信息孤岛”现象。