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目的:H5N1在东南亚广泛流行和不断向人类跨种属传播使得世界卫生组织相信,该病毒最有可能成为下一次人类大流感的流行株。为了解禽流感病毒的发生发展规律,我们对广西南宁活禽市场的禽类进行系统的流感病毒分子流行病研究,为禽流感的监控提供有力的实验依据,这对控制流感病毒在禽类及人类之间的传播并找出相应规律,将具有重要的现实意义。 方法:采用常规鸡胚尿囊腔接种法分离、扩增病毒,用血凝试验筛选出阳性病毒株并测定病毒效价,然后用血凝抑制实验、神经氨酸酶抑制实验和RT-PCR法鉴定禽流感病毒的亚型,最后选取部分病毒代表株进行8个基因片段的测序分析。将从广西分离得到的16株H5N1病毒代表株和已报道的香港、东南亚、广东等地禽流感病毒基因进行同源性分析并建立病毒基因种系发生树,从而了解广西禽流感病毒株在发生学及进化上的特点。 结果:从2463份标本中共分离得到202株流感病毒,其中H3亚型130株,H5亚型56株,H6亚型18株,H7亚型3株,H9亚型11株,H11亚型5株,H13亚型1株。基因分析的结果表明,2004年广西流感病毒H5N1的HA1和HA2连接肽氨基酸序列为REIRRKKR、RETRRRKKT或RERRRK-R均符合高致病性禽流感的分子生物学特征;2004年广西分离病毒包括Z和W两种基因型,目前以W型占绝对优势。 结论:1、2004年广西分离的禽流感病毒种类具有多样性;2、2004年广西分离的16株H5N1病毒与香港、广东、东南亚病毒在HA0裂解位点氨基酸序列上都符合高致病性的特点,但表现出不同的多样性。3、广西H5N1病毒均为重组病毒,NS基因和广东病毒GS/GD/1/96同源性较高,其他基因和东南亚病毒同源性较高,各基因和香港病毒同源性都有一定差距。4、2004年广西病毒以W为主要流行基因型,与当时香港、东南亚、广东等地区以Z基因型为主的流行趋势不同。