上市公司作为我国企业的精华,有力地推动了我国资本市场和市场经济的发展,但由于历史发展和制度环境等诸多方面因素的影响,我国上市公司中也存在许多问题,制约了上市公司的发展。这主要是因为上市公司资本结构不完善,导致了股东和管理者之间以及控股股东和中小股东之间的两类代理问题,降低了企业价值。大量研究证实,资本结构与代理成本存在着紧密地联系,历来是公司治理研究的重点,因此对该领域的研究有重大的价值。本文的研究目的在于筛选出对代理成本影响较大的资本结构相关因素,例如股权集中度、股权制衡等,并分别检验这些因素对两类代理成本的影响,从而有针对性提出改善上市公司治理结构的建议。目前国内众多学者在该方面的研究,大多将上市公司作为一个整体,较少对民营上市公司和国有上市公司进行对比研究,但两者在股权结构等公司治理机制上存在明显的差别,整体研究会产生偏差,因此本文分别选取了两类上市公司进行对比研究。本文在文献综述和理论分析基础上进行了研究设计,并选取了2003年至2008年间发生控制权转移的79家国有上市公司和49家民营上市公司作为研究样本,对研究假设进行了验证,得出如下结论：国有上市公司中更为严重的是第一类代理成本,但民营上市公司中第二类代理问题更为严重的假设没有得到证实；股权集中度与第一类代理成本的关系在全样本和国有上市公司中正相关,在民营上市公司中负相关,股权集中度与第二类代理成本均负相关,但对民营上市公司的影响大于对国有上市公司的影响,综合来看,国有上市公司应降低股权集中度,并保持在合适的区间,以将两类代理成本均降至最低,而民营上市公司应该适度提高股权集中度；股权制衡与第一类代理成本正相关,对国有上市公司的影响程度要大于其对民营上市公司的影响程度,股权制衡与第二类代理成本负相关,但对民营上市公司的影响程度要大一些,因此股权制衡也应该有一个合理的区间,民营上市公司更应注意发挥股权制衡对第二类代理成本的制约作用；管理者持股比例与第一类代理成本正相关,与第二类代理成本的关系则未通过检验,总体而言管理层持股作用未得到很好的验证；负债融资与两类代理成本均正相关,但国有上市公司中负债融资与第二类代理成本的正相关关系未通过显著性检验,仅从回归系数而言,负债融资与两类代理成本的关系对民营上市公司的影响程度均要大于其对国有上市公司的影响程度,可见民营上市公司中更应重视负债融资产生的问题。最后,针对实证分析发现的问题提出了相关建议,对国有和民营上市公司改善资本结构,降低两类代理成本提供了可鉴参考的方向。