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本研究选取部分G1 1778A突变的LHON家系，应用DNA序列分析及限制性片段长度多态(RFLP)分析等分子遗传学技术，进行mtDNA单倍型类群(haplogroup)分析，探讨mtDNA遗传背景(即haplogroup)对LHON 临床外显的影响；此外，选择X染色体上的3个微卫星DNA标记(microsatellite DNA marker)和2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism，SNP)作为遗传标记，通过LHON患者与正常对照的对比研究，探讨X染色体上是否存在影响LHON发病的特定区域。
第1部分携带G11778A突变的LHON患者的mtDNA单倍型类群
目的：了解我国G11778A突变LHON患者的mtDNA单倍型类群的分布特点。
材料方法：选择41个来自我国中南部地区携带G11778A突变的LHON家系，分析mtDNAD环(D-loop)的高变区Ⅰ(HVSI)和高变区Ⅱ(HVSII)及其它特定变异位点区域的DNA序列，结合特定mtDNA单倍型类群标志性位点的限制性片段长度多态性(RFLP)检测，将获得的mtDNA序列与东亚人mtDNA单倍型类群进化树进行比对，最终确定其mtDNA单倍型类群。
结论：LHON家系的mtDNA单倍型类群分布类型多样，有别于已报道的中国正常人群。表明mtDNA遗传背景可能影响我国人群中G11778A携带者的LHON临床外显。MtDNA单倍型类群F可能对LHON发病有抑制作用。
(结果已发表：Ji Y，et a1.Biochem Biophys Res Commun 2007；364(2)：238—42)
第2部分 MtDNA单倍型类群对携带G11778A家系成员LHON临床外显的影响
目的：探讨mtDNA单倍型类群对G11778A突变携带者LHON发病的影响。
材料方法：对收集的62个携带有G11778A突变的LHON家系，进行mtDNA 单倍型类群分型，统计临床外显情况。运用二元逻辑回归方法(Bilogistic regression)分析mtDNA单倍型类群对突变携带者LHON临床外显的影响。对特定单倍型类群的家系先证者进行全线粒体基因组直接测序，分析其影响外显的机制。
材料方法：收集无亲缘关系的176例携带G11778A突变男性LHON患者及100例男性正常对照。用荧光标记引物扩增结合毛细管电泳分析Xp21.1-q21.2区域内的三个微卫星DNA标记(DXS8090，DXS1069，DXS1068)的片段长度多态，RFLP方法分析该区域内的两个SNP(DYNIX3-rs11771，LANCL3-rs11266282)，并进行基因分型。用卡方检验或Fisher精确检验对两组间不同基因型频率进行统计分析，同时分析两组间X染色体多个遗传标记形成的单体型(haplotype)分布的差异。
结论：本研究未能证实Xp21.1-q21.2与G11778A突变携带者LMON发病相关，我国LHON患者发病相关的核调控基因仍需进一步研究。