肺癌在癌症致死率方面常居世界第一位。我国在世界上是肺癌高发国家,在男女性癌症患者中,肺癌都占据着极高的比例,且患者的五年生存率不足20%。肺癌的类型繁多,癌变机制复杂,难以被治愈。近年来,测序技术的发展使得个体化医疗呈现繁盛趋势,也为肺癌的个性化治疗带来的帮助。在本论文中,我们着眼于中国汉族肺癌人群的肧系突变,运用二代测序技术,辅助其他分析工具,目的是确定与肺癌风险性相关的易感基因及突变位点。我们的研究首先在780名散发汉族肺癌患者中,采用靶向捕获测序技术进行肧系突变的检测。分析结果显示在肺癌患者群体中一共检测出1017种突变,分布在68个基因区域。在所有的突变基因中（不考虑同义突变）,发生突变频率最高的是BRCA2、ATM、FANCA。突变图谱显示肺腺癌、肺鳞癌、小细胞肺癌和肺腺鳞癌没有表现出在突变基因选择上的特殊性;四种亚型的肺癌都没有表现出在某一年龄段具有明显的聚类;在男性患者中,肺鳞癌以及小细胞肺癌出现的比例要高于在女性患者中的比例。57.4%的非同义突变中发生在DNA损伤相关基因上。我们对基因共现性和互斥性的分析显示基因ATM和MSH6在肺癌中存在显著互斥的关系（Fisher’s p=0.003,q-value=0.04）。在进行了肧系突变的检测后,我们分析了在肺癌患者中检测到的突变基因在GO功能和KEGG通路上的富集情况。GO分析表明这些突变基因参与了DNA的多种损伤修复过程。KEGG分析结果表明在肺腺癌、肺鳞癌以及小细胞肺癌这三种肺癌亚型中突变基因均在‘范科尼贫血途径（Fanconi anemia pathway）’有着显著的富集,同样存在显著富集的还有‘同源重组（Homologous recombination）’。在本论文的四、五章中,我们在对高频突变位点进行致病性分析后,在正常人群中对存在致病风险的位点进行扩增子测序,利用病例-对照分析确定突变是否为肺癌的易感位点。在肺腺癌中的关联分析显示13个突变位点在进行FDR校正后仍表现出与肺腺癌显著的相关性;针对肺鳞癌患者独立的关联分析结果显示,9个突变位点在FDR校正后仍显示与肺鳞癌显著的相关性;针对小细胞肺癌患者单独的位点关联分析显示,3个突变位点在FDR校正后仍显示出与小细胞肺癌显著的相关性。总之,我们的研究显示中国汉族肺癌人群拥有极广的突变谱,而且基因ATM和MSH6的互斥关系揭示了这两种基因上突变的共表达可能会对肺癌肿瘤细胞产生负选择作用力。同时我们验证了十几个与肺癌风险性存在显著关联的位点,这些位点在进行进一步的功能性验证后,可能会为肺癌的治疗提供新的靶点。