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本实验以319头中国荷斯坦牛、68头鲁西黄牛及40头渤海黑牛为研究对象,利用PCR-SSCP、CRS-PCR以及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因的遗传多态,并采用最小二乘法拟合线性模型将各基因座不同基因型与奶牛乳腺炎进行了关联分析,结果表明:
1、本研究首次发现牛GlyCAM1基因存在5个新SNP,分别为5UNT第602位点存在T/A突变,内含子1第1489位点存在C/G突变、在内含子2第2239位点存在T/G突变、在外显子3第3095位点存在A/C突变、在内含子3第3431位点存在C/T突变。
2、采用DraⅠ、HindⅢ、MspⅠ、Hin1Ⅱ和Tru1Ⅰ酶切方法检测五个位点等位基因的多态性。结果显示,中国荷斯坦牛群体中五个位点的优势基因型为AA、优势等位基因为A。鲁西黄牛及渤海黑牛3095位点的优势基因型均为AB,优势等位基因分别为A、B;3431位点优势基因型均为AA,优势基因均为A,中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在此位点未检测到BB基因型。
3、经x2适合性检验,中国荷斯坦牛5个SNP位点仅3095位点基因座未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。鲁西黄牛和渤海黑牛在3095和3431两位点基因座位均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
4、采用最小二乘法拟合线性模型将该基因座不同基因型与奶牛乳腺炎进行了关联分析,结果表明胎次效应、场效应和泌乳月效应对乳腺炎的影响较大(P<0.01)。602位点基因型效应对SCS的影响未达到了显著水平(P>0.05),1489位点和2239位点BB基因型的SCS显著高于AB和AA基因型,3095位点BB和AB基因型SCS显著高于AA基因型。因此,可将1489、2239、3095三个位点AA基因型作为抗乳腺炎性状的优良基因型。