三农（农业、农村和农民）问题自改革开放之后一直都是党中央高度关注和急需解决的问题，是关系到我国现代化建设的重要因素。党的十六大明确提出了我国已经进入全面建设小康社会、加快推进现代化的新的发展阶段。我国的第十一个五年规划中，明确指出要建设社会主义新农村，推行城市支持农村、工业反哺农业，促进城镇健康持续发展。如何建设社会主义新农村、当下的社区股份公司有何弊端、如何改革才能最适合我国农村的发展现状，如何增加农民收入、改善农村面貌、促进农业发展，成为了我国广大学者研究的重点问题。社区股份公司作为农村集体经济组织在深圳市的主要存在形式，存在职能过杂，商政混合等诸多问题，为了更好的管理集体资产，实现利益最大化，社区股份公司在运营模式及经营管理等各个方面都需要进行改革。就坪山新区来说，坪山新区股份合作公司存在着大量的旧工业园和旧屋村，全区存在较多的老建成区、旧城、旧村等区域，这些区域基本大多兴建于上世纪八九十年代，建设标准低，公共服务设施欠缺，存在大量的危旧房屋，亟需改造。本文首先分析了研究背景和国内外的研究现状，然后阐述了农村集体经济组织的含义及与其发展相关的理论基础，接着以深圳市坪山新区为例，从社会和企业两个角度分析了现阶段社区股份公司存在的问题以及问题出现的原因，最后提出了解决这些问题所应当遵循的原则和采取的措施。