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马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是全球性分布的重要病毒,主要危害烟草、马铃薯、辣椒、番茄等茄科作物。本研究从山东安丘和泰安的烟草上分离得到2个PVY分离物AQ4和FZ10。生物学实验表明,这两个分离物在中烟100等12个烟草品种上产生不同程度的花叶和斑驳。通过RT-PCR和5′-RACE克隆并测定了AQ4和FZ10两个PVY分离物的全基因组序列。除了3′-末端poly(A)尾巴,AQ4和FZ10全长分别为9700个和9699个核苷酸,均含有一个大的开放阅读框,均编码由3061个氨基酸组成的多聚蛋白。这一多聚蛋白被9个酶切位点分成10个功能蛋白。通过对全基因组核苷酸的一致率比较分析,分离物AQ4和FZ10与国内外的PVY分离物的核苷酸一致率分别在97.3%-85.3%和95.2%-83.9%之间。AQ4分离物与261-4分离物的核苷酸一致率最高达97.3%,与NIB-NTN分离物的核苷酸一致率最低为85.3%。FZ10分离物与PVY-12分离物的核苷酸一致率最大达95.2%,与PVY-MN分离物的核苷酸一致率最小为83.9%。它们与国内外的PVY分离物的氨基酸一致率分别在98.6%-92.2%和98.5%-91.8%之间。AQ4和FZ10均为N和O株系分离物的重组体。AQ4分离物1-496 nt和2497-9700 nt来源于PVYO株系的分离物Oz,497-2496 nt来源于PVYN株系的分离物CH-605。FZ10分离物1-496 nt和2497-6533 nt来源于PVYO株系的分离物SASA-110,497-2496 nt和6534-9699 nt来源于PVYN株系分离物CH-605。系统进化树结果表明,AQ4属于PVYN:O亚组,而FZ10属于重组的PVYNTN亚组。AQ4和FZ10的基因型分别属于PVYN:O和PVYNTN,有PVYN株系的HC-Pro,但致病型与PVYO株系相同,说明除了HC-Pro外,还有其它基因控制PVY在烟草上引起坏死症状。