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本文的主要研究内容包括如下几个方面：
1.提出了一种DNA序列的三维图形表示方法，避免了一些之前提出的生物大分子序列的图形表示模型的缺陷。并用该方法分析了11个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子编码序列之间的相似性。
2.对用图形表示方法进行生物序列的相似性分析的合理性问题进行了初步的探讨。提出了一个检验图形表示模型的灵敏性的一般方法，可以适用于各种各样的图形表示模型。
3.提出一种基因识别方法，对酿酒酵母基因组进行基因识别。识别的准确度>96％，对酿酒酵母基因组的基因总数给出估计约为5920，与普遍接受的酿酒酵母基因总数约为5800～6000的观点相符合。