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目的：检测RUNX3在腺腔A型(luminalA，LA)、腺腔B型(LuminalB，LB)、HER-2过表达型(Human epidermal growth factor receptor, HER-2+)、基底样型乳腺癌(Basal-like breast cancer, BLBC)4种不同分子亚型乳腺癌中的蛋白表达和启动子甲基化状态及其与临床病理参数的关系。 方法：分别采用免疫组化SP法和甲基化特异性PCR(MSP)方法检测88例乳腺癌组织中RUNX3基因蛋白表达和启动子甲基化水平，并分析其与临床病理参数的关系。 结果：1.LA、LB、HER-2+、BLBC乳腺癌的蛋白表达率分别为26.1％,45.0％，76.2％，75.0％;甲基化率分别为69.6％，85.0％，47.6％，29.2％，BLBC和HER-2+型RUNX3蛋白表达率最高，与LA和LB相比差异均有统计学意义(P＜0.05）;甲基化率与蛋白表达呈负相关:ER阳性乳腺癌包括LA和LB与BLBC的甲基化率差异有统计学意义(33/43(76.7％)vs.7/24(29.2％)，P＜0.05); HER-2+型仅与LB型差异有统计学意义((10/21(47.6％)vs.17/20(85.0％)，P＜0.05);进一步分析甲基化的结果:HER-2+型与ER阳性乳腺癌的差异有统计学意义(10/21(47.6％)vs.33/43(76.7％)，P＜0.05); ER阴性乳腺癌(包括BLBC和HER-2+)与ER阳性乳腺癌差异有统计学意义(17/45(37.8％)vs.33/43(76.7％)，P＜0.05）。2.在RUNX3蛋白阳性表达和阴性表达的乳腺癌患者中，基因启动子甲基化率分别为36.7％和82.1％，差异有统计学意义(P＜0.05)。3.49例RUNX3阳性病例均以RUNX3蛋白胞浆定位为主，部分病例伴有一定程度的胞核定位，各亚型之间RUNX3细胞内定位的差异无统计学意义。4.RUNX3基因启动子甲基化与组织学分级、临床分期相关(P＜0.05)，与患者年龄、肿块直径及淋巴结转移不相关。 结论：RUNX3蛋白表达缺失和启动子甲基化主要见于ER阳性乳腺癌，启动子甲基化可能是其蛋白表达缺失的主要机制，RUNX3蛋白的胞浆定位可能与其在乳腺癌中的功能异常相关。RUNX3与乳腺癌传统预后因素相关。RUNX3基因蛋白表达缺失和启动子甲基化在BLBC的发生发展中可能不起主要作用。