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根结线虫是重要的制约及危害农作物的病害之一,它可寄生的植物范围较广,传播途径多,也是农作物中较难防治的土传病害之一,根结线虫病同样也危害烟草。由于植烟土地轮作制度,复种指数增加,根结线虫病给各植烟产区造成的危害和损失也日趋严重,一般可造成烟叶减产30%-50%。目前生产上使用的防治方法虽然很多,但是防治效果并不显著,不仅不能够从根本上解决根结线虫病害问题,还会给植烟环境造成较严重污染,给环境治理造成较重的负担;而培育烟草抗根结线虫病品种,增强烟草本身对根结线虫病的抗性,是最经济有效的解决方法。我国有较丰富的烟草种质资源,这为烟草根结线虫病抗性育种提供了材料基础。关联分析是近几年来逐渐发展起来的新方法,能够找到与植物性状直接相关联的分子标记。本研究通过关联分析的方法探寻与烟草抗根结线虫病性状相关联的分子标记,为烟草根结线虫病抗性育种工作提供一定的理论依据。本研究选取81份烟草种质资源材料作为研究对象,鉴定每个种质资源的根结线虫病抗性,同时用70对SSR分子引物扩增的群体全基因组多态性数据,结合NTSYS软件、STRUCTURE软件及TASSEL软件对烟草种质资源群体的遗传特征及群体结构进行分析,主要结果如下:1.连续对81份烟草种质材料根结线虫病抗性进行了2年的表型鉴定,2015年根结线虫病抗性鉴定结果中显示高感材料5份,感病材料45份,中抗材料20份,抗病材料11份;2016年抗性鉴定结果显示高感材料4份,感病材料46份,中抗材料22份,抗病材料9份。其中抗病性状变异系数范围在32.96%-37.57%之间。结果表明供试种质材料在根结线虫病抗性性状上表型多样性较大。2.利用筛选出的70对SSR引物对81份烟草种质材料进行分析,一共检测到434个等位变异,平均每对引物可以检测出6.2个等位变异,表明SSR分子标记的多态性较高;各引物的多态性信息指数PIC值变化范围为0.18~0.91,PIC平均值为0.63。3.用STRUCTURE2.3.4软件对烟草群体结构进行分析,将81份供试烟草种质材料划分两个亚群即P1和P2,分别包含45份和36份材料。NTSYS-pc2.10e软件遗传聚类分析结果也是将81份材料划分为两个亚群,与群体结构分析结果相一致。4.对群体进行连锁不平衡分析,r~2多分布在0-0.2的范围内,r~2平均值为0.034,表明81份烟草种质材料群体中存在一定连锁不平衡。5.通过TASSEL软件的GLM模型的关联分析,检测到4个与烟草根结线虫抗性相关联的分子标记;MLM模型的关联分析检测到3个与烟草根结线虫病抗性相关联的分子标记;其中PT30123和PT30296分子标记是GLM模型、Q模型、K模型以及K+Q模型共同检测到与烟草根结线虫抗性性状显著关联的分子标记。