高粱遗传连锁图谱的构建及重要农艺性状QTL初步定位

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高粱作为世界五大粮食作物之一,广泛分布在世界的热带干旱和半干旱地区,是许多国家重要的粮食来源和饲料作物。高粱以其相对较小的基因组(750Mbp),丰富的遗传多样性,已经成为禾谷类作物比较基因组学研究的模式基因组之一。同时,作为一种重要的能源作物,在可再生的生物质能源的开发中也受到广泛的重视。利用分子标记技术,在许多作物上已获得了高密度的分子遗传图谱,并定位了许多主要农艺性状的QTL。本研究以高粱T70、P607为亲本构建的重组自交系群体作为研究材料,采用植物数量性状新模型和分子标记技术为研究手段,对高粱的株高、穗长、花期等重要的农艺性状进行连锁图谱的构建以及QTL定位研究。共应用了121对SSR引物进行多态性筛选,Mapmaker3.0软件进行连锁分析,构建高粱的遗传连锁图谱。采用复合区间作图法,利用QTL作图软件WindowsQTL Cartogragher2.5对高粱重要的农艺性状进行QTL定位和表型性状的QTL效应验证。取得的结果如下:1)通过群体表型数据的描述性统计分析发现,除分蘖性状偏离正态分布外,其他性状都符合近正态分布,可用于遗传连锁图谱的构建。2)利用121对SSR引物对T70×P607杂交得到的RIL(F6代)群体218个家系进行了多态性分析,利用其中24对引物构建了高粱的遗传连锁图谱。该图谱覆盖高粱全基因组长度为541.9cM,覆盖率为72.25%左右,包括7个连锁群,分别锚定于高粱的5条染色体上,两标记间平均图距为17.5cM。3)利用Windows QTL Cartographer2.5软件对整个基因组进行扫描后共检测到控制高粱株高、穗长、主穗柄长度、主茎节数、分枝、主茎高度、旗叶天数、开花天数、结实天数共9个重要农艺性状的15个QTL位点,但是LOD值大于2.5的只有控制株高的3个QTLs。后续研究可通过增加SSR引物数量、群体数量,并结合其他分子标记技术对图谱进行加密以进一步精确定位关键性状的QTL位点。本研究构建的分子标记连锁图谱及相关农艺性状的QTL定位将对高粱主效QTL的精细定位和分子标记辅助育种提供依据,同时所获得的QTL将对高粱新品种的选育具有一定的理论指导意义。
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