当前，中国经济发展与生态环境保护的矛盾凸显。为促进区域协调发展，中国政府提出实施主体功能区划战略。遵循主体功能区划相关思想和理论指导，选用对区域开发建设影响较大的地形因子和自然生态服务因子构建生态敏感性评价体系，划分区域生态环境约束性等级；从地方资源承载力、现有开发密度、未来发展潜力3个准则层构建区域经济发展潜力评价体系，划分区域经济综合发展潜力的等级；采用空间聚类分析方法，叠加分析区域生态环境约束性等级区划与区域经济综合发展潜力的等级区划结果，分别确定评价单元的自然价值和经济价值，然后用列联表互斥的矩阵分类方法，进行经济开发价值与生态保护价值的分类，集成综合开发和保护价值，提出各评价单元的开发方向，统筹考虑未来人口分布、经济布局、国土利用和城镇化格局，统筹考虑地方发展意愿，协调各方利益诉求，选择贵州省重点生态功能区雷山县开展县域尺度的主体功能区规划与发展研究，具体研究内容包括：1）梳理了相关概念、总结了主体功能区划相关研究现状；2）设计了重点生态功能区主体功能区划的技术体系，构建了生态敏感性评价体系和经济发展潜力评估体系；3）探讨了重点生态功能区主体功能区划的理论和方法，为区划实践提供理论和方法支撑；4）在分析雷山县自然资源，生态环境及社会经济现状的基础上，对雷山县主体功能区划进行了实证研究；5）研究了雷山县主体功能区划建设的驱动机制。　　最终得出以下结论：　　（1）提出县域主体功能“三生”空间的分区技术体系及“3+N”型功能区划方案，并指出各功能区块的边界应随着区域发展适时适当微调。随着区域发展，各功能区块实际可能与既定功能定位不匹配，因此各功能区块边界的划分不应该是一个刚性“红线”，而应该随着区域发展实时适当调整，而且在重点生态功能县域主体功能区块的划分过程中应该划分一定范围的“空白”区块备用。　　（2）提出“小笼包”型城镇化发展是重点生态功能区城镇化现实出路，并指出有待加强研究各功能区块间的协调发展及生态补偿。城镇化是推动区域发展的重要抓手，通过城镇的聚集效应可以实现产业聚集和人才聚集。在限制开发的重点生态功能区，照搬重点开发区“摊大饼”型城镇化发展路径也行不通，走“蒸小笼包”的生态型城镇化发展道路是推动重点生态功能区发展的现实出路。重点生态功能县内不同功能区块承担的生态保护功能不同，发展受限程度也不尽相同，如何协调各功能区块间的发展及分配生态补偿是未来研究的重点。　　（3）提出发展特色生态农业能持续保障生态服务功能供给，并指出生态功能区生态保护成本的估算，补偿标准的制定、实施保障有待进一步研究。重点生态功能区往往承担着维系区域生态安全和供给生态产品的生态服务功能。良好的生态环境本底，蕴含丰富的中草药、山野菜、珍果等特色农业资源，发展特色生态农业是生态功能区解决保护与发展矛盾的出路。当然，重点生态功能区为维系区域生态安全牺牲了发展机会，因此，受益地区应该对承担生态保护功能的区域进行经济补偿，但现有研究对重点生态功能区生态保护成本的估算、生态补偿标准的制定，生态补偿的落实保障等问题研究不足，下一步应该加强相关研究。　　（4）提出通过旅游开发助推区域经济发展，构建了“造血”和“输血”两种通过旅游开发促进资源保护的驱动模式，并指出在旅游开发过程中应寻求保护与利用间的平衡点。旅游被公认为是没有污染的工业，其对经济的拉动作用巨大，在少数民族聚居的生态功能区，发展旅游业是助推区域经济发展的强劲动力。但值得关注的是，生态功能区内的一些靓丽风景区往往也是“生态禁区”，过载的人类活动，不合理的旅游开发将给该类区域带来毁灭性的灾难，因此在旅游开发过程中如何保护与利用该类区域必须引起重视。　　（5）提出划定生态红线保障区域生态安全，以森林防护、河流保护治理为重点构筑生态屏障，并指出应继续加强河流、水库的保护、治理机制建设研究。森林、河湖、湿地对维系区域生态安全至关重要，通过以森林、河流、重点水源地、湿地为骨架的生态屏障建立能维系区域生态安全。但是森林群落的演替、河流、水源地水质监测、河道的治理保护都应建立相应的保护机制加以保障实施。比如：河流的保护是以流域范围建立保护机制还是按流经行政区域建立保护机制等问题值得进一步深入研究。