酵母基因芯片的制备及其在热休克基因表达谱研究中的应用

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在所有的真核生物中,人们对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)分子遗传学方面的认识最早,最先完成的真核生物基因组序列测定也是酿酒酵母的基因组序列。接下来的工作就是阐明酵母的基因表达模式及其基因产物的功能,为了使这项工作进行得更加顺利,必须寻找一种既系统又全面的方法,来解释酵母细胞中基因表达的模式和产物的功能以及产物之间的相互作用。 本研究利用RD—PCR(Restriction Display-PCR,RD—PCR)技术,从酵母细胞中分离出大量cDNA片段,克隆和构建了cDNA片段文库,进一步将单基因片段纯化出来,建立了相应的数据库对所有信息进行管理。经纯化的cDNA片段作为基因芯片的探针。采用Cartesian基因芯片打印仪,将纯化的cDNA片段打印在CORNING玻片表面,制作了酵母细胞基因表达谱芯片。最后提取热休克前后酵母细胞的总RNA,经逆转录标记合成cDNA后与酵母基因表达谱芯片杂交,初步研究了酵母细胞在热应激时基因表达的变化。 综上所述,本研究采用RD—PCR技术,探索了利用该技术快速分离大量cDNA片段的具体过程,并建立了酵母cDNA文库及酵母cDNA探针文库,为DNA芯片的制备打好基础。然后利用基因芯片信息量大、快速、敏感等特点,对热休克后的酵母基因表达的改变进行了初步的研究,对于全面认识热休克以及热休克引起的细胞内部变化机制具有重要意义。
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