目的:本研究旨在检测肺癌组织中SOX9表达情况,并分析SOX9在非小细胞肺癌中的表达与患者临床病理因素和预后关系,进一步来探讨SOX9为肺癌的临床诊疗提供的临床价值。方法:利用生物信息学分析技术筛选出肺癌肿瘤干细胞中差异表达显著的SOX9基因后,首先收集40例我院非小细胞肺癌患者术后肺癌组织、癌旁组织及临床资料。利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测标本组织中SOX9 mRNA表达水平。结合免疫印迹实验（Western blotting）与免疫组化实验检测肺癌组织中SOX9蛋白表达水平,以验证分析SOX9是否在非小细胞肺癌组织中过表达。根据初步实验结果,再购买87份2004年6月²009年6月收集的人肺癌组织组成的芯片（HLugA180Su06）进一步扩大组织标本量,包含87份肺腺癌组织标本蜡块及患者详细资料,随访10年。采用苏木精-伊红（HE）染色法确定各组织标本蜡块的病理诊断;利用免疫组化实验分析肺腺癌患者SOX9蛋白表达水平,并分析其与临床病理特征间的关系及预后关系,再利用Kaplan-Meier plot在线数据库验证SOX9与患者生存预后的关系。结果:1.生物信息学分析表明与对照细胞相比,多种基因（包括SOX9基因）在肺癌成球（干）细胞中高表达,其中SOX9基因过表达差异显著。2.符合纳排标准的临床病例的组织样本共40例,对应患者临₁床病理特点如下:男性患者21例（52.5%）,女性患者19例（47.5%）,中位年龄为63岁,其中≥60岁者有25人（62.5%）,<60岁者有15人（37.5%）。患者术后病理类型诊断中肺腺癌患者有31例（77.5%）,肺鳞癌患者7例（17.5%）,其他类型2例（5.0%）。伴有淋巴结转移阳性患者有10例（25.0%）,有30例（75.0%）淋巴结转移为阴性。临床分期Ⅰ+Ⅱ期有32人,Ⅲ+Ⅳ期有8人。随访6个月,40人中仅1例（2.5%）因脑转移死亡,余39例（97.5%）存活。检测结果为癌组织中SOX9的mRNA及蛋白表达量较配对的癌旁组织中表达量均有显著地升高（P<0.05）。3.扩大样本量实验验证:（1）HE染色结果示87例肺癌组织均诊断为肺腺癌;（2）患者临床资料分析显示:临床分期为Ⅰ期有28例,Ⅱ期25例,Ⅲ期32例,Ⅳ期1例。肺腺癌主要在老年人（50,57.5%）中发生,男性患者发病47（54.1%）例略高于女性患者（40,45.9%）,87例中有33（45.9%）例出现不同程度的淋巴结转移情况,有39（54.1%）例未发现淋巴结转移。87份肺腺癌组织标本均检测到SOX9蛋白高表达。SOX9高表达组有45例,占51.7%,低表达组有42例,占48.3%。随访10年有28例患者存活,生存率为32.1%,有59例患者死亡,死亡率占67.8%。（3）78对肺腺癌及癌旁组织进行染色并分别分析细胞浆与细胞核SOX9表达差异。胞浆内SOX9染色结果显示,有41例（52.3%）高表达,而癌旁组织中SOX9蛋白均较低（78,100%）,且差异有统计学意义（χ²=55.617,P<0.001）。胞核SOX9染色情况示与癌旁组织相比较,胞核SOX9表达量在肺癌组织中也显著增高（χ²=55.841,P<0.001）。4.细胞浆内SOX9的表达量与肺腺癌患者临床病理因素的相关性:与无淋巴结转移（N₀）的患者比,在有淋巴结转移（N₁^N₃）的肺腺癌患者SOX9的表达水平显著升高（χ²=6.998,P=0.008）;与T₁/T₂期患者比,T分期为T₃/T₄的患者肺腺癌组织中SOX9表达显著升高（χ²=5.202,P=0.023）;与临床分期Ⅰ/Ⅱ的患者比,临床分期高（Ⅲ/Ⅳ）的SOX9高表达越显著（χ²=7.362,P=0.007）。即患者的临床分期（TNM分期）越高,细胞浆SOX9表达的水平越高。但细胞浆SOX9的表达差异与患者年龄、性别以及癌组织病理分级、是否有远处转移（M分期）无关（P>0.05）。5.细胞浆内SOX9蛋白表达与病理恶性程度、临床分期的相关性:（1）将免疫组化染色结果与病理分级（分化程度）做了对比显示,高分化组织、中分化组织、低分化组织中的胞浆SOX9表达量随分化程度降低而明显上调。同时统计了患者肺腺癌细胞浆SOX9阳性表达率,发现随分化程度降低,胞浆SOX9表达量有增高趋势。但低分化组与中分化组间的差异没有统计学意义（P>0.05）。（2）免疫组化结果与临床分期（TNM分期）对比显示,肺腺癌患者临床分期越高,癌组织中的胞浆SOX9表达量越高,肺腺癌组织中含有肿瘤细胞的区域存在高水平的SOX9表达。相反,SOX9在正常肺组织中几乎检测不到。6.细胞浆内SOX9表达水平与肺腺癌患者预后情况的关系:生存期分析显示细胞浆SOX9高表达的患者中位生存时间为30个月（95%CI为24.367³5.633个月）,而低表达组的中位生存时间为56个月。细胞浆SOX9高表达组的中位生存时间明显低于SOX9低表达组,10年生存率为32.1%,差异有统计学意义（P<0.001）。通过Keplan-merier Plotter数据库验证结果与上述预后情况相一致。7.细胞核内SOX9的表达增加与肺腺癌患者临床病理因素的关系:女性肺腺癌患者胞核SOX9的表达水平比男性明显增高（χ²=7.878,P=0.005）;与TNM分期较低的患者比,TNM分期较高的患者胞核SOX9表达显著升高（χ²=4.185,P=0.041）。但胞核SOX9的表达水平与患者年龄、病理分级、T分期、N分期以及是否有远处转移均无明显关系（P>0.05）。8.细胞核内SOX9表达水平与肺腺癌患者预后情况的关系:胞核内SOX9高表达组与低表达组的患者中位生存时间均为39个月（95%CI分别为29.039⁴8.961个月、21.181⁵6.819个月）。且胞核SOX9高表达组的中位生存时间与低表达组间并无差异（P=0.154）。9.影响肺腺癌患者生存期的临床病理因素的单因素及多因素分析:细胞浆SOX9高表达组与低表达组患者病例特征单因素Cox分析显示细胞浆SOX9表达水平（HR=2.703,P=0.001）、病理分级（HR=1.965,P=0.007）、淋巴结转移（HR=1.748,P<0.001）和TNM分期（HR=1.701,P=0.001）差异均显著影响患者生存时间。Cox多因素生存回归分析,结果表明细胞浆SOX9表达水平（HR=2.414,P=0.022）、N分期（HR=1.451,P=0.044）是影响肺癌患者生存预后的独立危险因素。结论:1.结合生物学信息与临床分析提示SOX9在肺癌组织中呈异常高表达状态,提示SOX9可能是促进非小细胞肺癌发生的潜在功能基因,也为进一步研究SOX9在非小细胞肺癌中的功能提供了理论基础。2.随肺腺癌分化程度降低,胞浆SOX9表达量有增高趋势。我们认为肺腺癌细胞恶性程度与胞浆内SOX9表达量可能有关系。3.肺腺癌患者的临床分期越高,癌组织中SOX9表达水平无论胞浆还是胞核内均越来越高。且胞浆SOX9高表达的肺腺癌患者总生存期明显缩短。提示SOX9可作为肺腺癌患者各期预后的重要指标;且危险因素分析提示胞浆SOX9高表达是影响肺腺癌患者预后独立危险因素。4.胞浆SOX9表达情况与病例T分期、淋巴结转移数、TNM分期和肺腺癌患者的生存状态均相关,虽然胞核SOX9的表达水平与患者TNM分期也有关系,但其与患者生存时间并无相关性,提示胞浆内SOX9的表达水平或可能是促进肺腺癌患者病情发展的主要因素。5.SOX9蛋白在肺腺癌细胞质和细胞核的表达结果不同,即胞浆内SOX9高表达患者预后明显缩短,而在胞核高表达SOX9患者生存时间并不受影响,提示SOX9发挥作用的主要途径可能在细胞质内存在,需进一步探究具体机制。6.不同性别肺腺癌患者胞核SOX9表达水平不同。