本研究选用几种不同的紫花苜蓿品种，采用蛭石和土壤作基质与不同的苜蓿根瘤菌进行匹配试验，筛选高效共生根瘤菌，并应用分子标记技术进行跟踪检验。 初筛试验选用10株不同的根瘤菌接种三个紫花苜蓿品种(奔马、金太阳、金皇后)，以植物地上部分干重、有效根瘤数、总根瘤数、粗蛋白含量为指标，初步筛选到了四株高效根瘤菌，分别为G303、R193、R362、N210(CCBAU)。再用土壤盆栽试验对蛭石筛选到的四株高效根瘤菌，分别接种三个苜蓿品种，结果表明，以地上部分干重、地上部分含氮量、总含氮量为筛选指标，R193、R362、N210(CCBAU)三菌株与奔马紫花苜蓿品种接种效果均好，与对照相比地上部分干重增加了83.51％、75.25％、77.32％，地上部分全氮量增加了79.87％、73.83％、61.04％。田间微区扩大试验采用R193、R362、N210(CCBAU)三菌株接种奔马品种，与对照相比干草产量分别提高了13.87％，13.84％，10.33％；蛋白质产量分别提高了20.89％、15.54％、16.47％。其中R193菌株与奔马紫花苜蓿品种接种效果最好。 为了对根瘤菌进行跟踪检验，比较试验了SDS-PAGE、ERIC-PCR两种标记方法，并以ERIC-PCR计算占瘤率，盆栽试验三菌株R193、R362、N210(CCBAU)的占瘤率分别为50％、44.4％、50％；微区试验R193菌株的占瘤率为33.3％，说明该菌株具有较强的结瘤竞争能力，可望进行推广应用。