lncRNAs调控氧化石墨烯致秀丽线虫毒性的分子机制研究

来源 :东南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:smaboat
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
作为一种新型纳米材料,氧化石墨烯(Graphene oxide, GO)因其优异的生物相容性与理化特性,在众多领域有着广泛的应用前景。同时其安全性以及环境暴露可能产生的毒副作用与潜在机理也逐渐引起人们的关注。模式动物秀丽线虫已广泛应用于环境毒物毒性评价以及毒理学研究。实验室之前的研究已经从mRNA和miRNA的水平阐述了可能的氧化石墨烯在秀丽线虫中的致毒机制。长链非编码RNA (long noncoding RNA, lncRNA)一般定义为碱基长度大于200bp的非编码RNA,可参与调控多种生物进程。然而到目前为止,lncRNA在调控工程纳米材料体内毒性中的作用还不十分清楚。在本研究中,我们利用秀丽线虫分析评价体系,借助Hiseq2000高通量测序技术分别对对照组和GO处理组进行了转录组测序,从而筛选可能与调控GO材料秀丽线虫体内毒性相关的lncRNA。结合测序分析结果和qRT-PCR验证结果,鉴定并确认了GO暴露处理后仅有34个lncRNA发生差异表达。进一步预测lncRNA-miRNA靶向作用网络,并在这个基础上对候选lncRNA进行GO分析和KEGG分析,结果显示候选lncRNA参与包括生长、发育、生殖、细胞定位、转运、信号传导和细胞代谢在内的许多生物进程以及参与多种信号通路。此外,实验发现GO材料表面PEG化学修饰或者FBS包被以及在clk-1和isp-1突变体背景下均能降低GO体内毒性,使线虫对GO毒性展现出一定的抗性。基于这个发现,我们通过qRT-PCR并利用化学修饰和突变体背景下GO体内毒性降低进一步筛选与GO材料体内毒性相关的lncRNA。实验发现,在这两种降低GO体内毒性的进程中,linc-37和linc-14的表达模式发生了改变。进一步的实验提供了直接的证据证实材料表面修饰(PEG表面修饰和FBS包被)和突变体背景下(clk-1和isp-1)降低GO体内毒性共有的linc-37以一种负调控的方式调控着GO在秀丽线虫体内毒性。双突变实验证实linc-37可能与daf16基因编码的转录因子FOXO相互作用,在daf-16基因的控制下发挥其生物学功能。本研究从全基因组的范围内筛选调控氧化石墨烯体内毒性的lncRNA,并鉴定其生物学功能,暗示了lncRNA在调控工程纳米材料体内毒性过程中的重要功能。
其他文献
民间工艺美术是中国传统文化的重要组成部分。随着现代科技的发展,民间工艺美术的自然生命与文化生命的关系逐渐发生偏离。该文通过论述人、物与自然之间的相互关系,说明人与
目的:如今,下尿路功能障碍,如膀胱过度活动症、膀胱流出道梗阻、压力性尿失禁、膀胱疼痛综合征等的发病率逐年升高。如何建立这些疾病的动物模型,对发现这些疾病的病因、探讨
会同县粟裕同志纪念馆经省文物局批准列入湖南省第二批免费开放的纪念馆.在各级党委、政府、文物部门的重视下,为满足人民群众的精神文化需求发挥了重要作用.粟裕同志纪念馆
乌梁素海是寒旱区典型的灌区湖泊,同时汞砷污染已经受到人们的密切关注。在自然作用及其人为活动的影响下,向大气排放的汞砷通过沉降进入水环境中,继而在大气、水体、沉积物
目的探讨小切口手术治疗腰椎间盘突出症的技术方法及临床疗效。方法对106例腰椎间盘突出症患者采用腰背正中小切口,在椎板间开窗行腰椎间盘髓核摘除,同时对神经根、侧隐窝进行
在经济蓬勃发展的新时期下,各种思潮及变革所带来的问题越发突出。基于此,在新时期的党建工作中,精神文明建设占据着不可忽视的地位。从党建与精神文明建设结合的重要性出发,