近年来,我国创新投入力度不断加强,已成为世界第二大研发执行国。创新投入攀升的同时,以科技进步贡献率为代表的技术进步水平却未呈现明显的增长趋势。创新要素投入区域间高度不平衡,内部结构分散、重复、封闭的“碎片化”问题突出。在空间和价值链两个维度上,创新资源的配置亟待优化。在我国经济发展进入“新常态”的背景之下,长三角地区创新能力不仅作为经济增长的核心驱动力影响作用日益加强,还成为衡量地区经济发展质量的重要参考。另一方面,地区内部发展不均衡、协同创新合作机制不健全、一体化程度有待深入的问题仍然存在。实现新时期长三角地区高质量一体化发展的战略目标,需要进一步优化配置三省一市的创新资源,全面提升区域整体创新效率水平,放大创新效率的外溢效应,以此拓展协同创新的深度与广度。为了更加科学准确地认识长三角地区创新发展的现实情况,探究各城市创新效率的结构差异与空间差异,进而分析其外溢效应,本文根据创新价值链理论将城市创新活动过程划分为两个主要环节:研发创新与生产创新。收集整理2003至2017年各城市创新面板数据,使用超效率DEA模型对两个环节的效率水平分别进行测算,对其空间分异与演变趋势展开分析。设定空间计量模型对创新效率的价值链外溢效应和空间外溢效应进行回归检验,同时使用地理特征和经济特征两类型的空间权重矩阵用于作用机制的对照分析。研究获得以下主要结论:(1)在研究时段内,长三角地区城市整体上研发创新效率水平落后于生产创新,趋向于“研发弱,转化强”的模式。仅有少数城市研发创新效率较高,较多城市在研发和生产两个环节均表现不佳。各城市研发创新效率和生产创新效率水平处于上升过程,地区分布呈现出“集聚——外溢——均衡”的发展态势,内部差距不断缩小。相较于研发创新,生产创新空间外溢效应更为缓慢。(2)长三角地区城市研发创新效率存在显著的正向空间外溢效应,但与城市经济发展水平高度相关。生产创新效率与之相反,高水平城市更加依靠地理邻近性来进行此环节的空间外溢。生产创新效率对研发创新效率的空间外溢效应均为正但并不显著,一个城市生产创新效率的提高,并不能显著提升周边城市和经济发展水平相近城市的研发创新效率。研发创新效率对临近城市和经济发展水平相近城市的生产创新效率产生不利影响,其中对于经济发展水平相近城市的抑制作用更为强烈。(3)长三角地区城市创新效率的价值链前向外溢作用显著,后向外溢相较于前向外溢作用强度更弱,研发创新和生产创新之间产生了一定的效率“脱节”现象。针对长三角地区城市创新效率的发展现状,以及外溢效应作用过程中存在的问题,本文提出以下对策建议:优化研发资源共享平台,全面提升创新效率水平;完善创新服务体系,促进科技成果高效转化;提高创新资源配置水平,构建紧密型区域协同创新体;弱化地域隔阂,共同实现高质量一体化。