【摘 要】
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目的:应用16S rRNA基因测序技术检测儿童社区获得性肺炎（community-acquired pneumonia,CAP）、急性化脓性扁桃体炎（acute suppurative tonsillitis,AST）患儿与健康儿童口咽部菌群差异。方法:收集2018年12月至2019年07月在我院首诊收治的3组患儿咽拭子标本,包括CAP 31例、AST 9例及化验检查结果未提示存在感染且无感染临床
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目的:应用16S rRNA基因测序技术检测儿童社区获得性肺炎（community-acquired pneumonia,CAP）、急性化脓性扁桃体炎（acute suppurative tonsillitis,AST）患儿与健康儿童口咽部菌群差异。方法:收集2018年12月至2019年07月在我院首诊收治的3组患儿咽拭子标本,包括CAP 31例、AST 9例及化验检查结果未提示存在感染且无感染临床表现的骨儿科住院患儿作为对照组（control group,CG）10例,所有儿童采集样本前3天内均未使用过抗生素或微生态制剂,基于Illumina Miseq测序平台,扩增细菌16S rRNA基因V3-V4区进行测序,并对口咽部菌群进行特征分析。结果:（1）CAP组与CG组比较Shannon指数、Obeserve＿OTUs数量、Faith＿PD均为P<0.05,差异有统计学意义,而AST组与CG组比较均为P>0.05,差异无统计学意义;CAP组、AST组与CG组Evenness指数比较,差异均无统计学意义;（2）门水平菌群组成,3组样本优势菌门均为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门,各组间无明显差异;（3）属水平菌群组成,CAP组优势菌属为链球菌属、普雷沃氏菌属7、韦荣氏菌属、奈瑟氏菌属、嗜血杆菌属、纤毛菌属、卟啉单胞菌属;AST组优势菌属为链球菌属、普雷沃氏菌属7、韦荣氏菌属、奈瑟氏菌属、卟啉单胞菌属、梭杆菌属、孪生球菌属;CG组优势菌属为链球菌属、普雷沃氏菌属7、韦荣氏菌属、纤毛菌属、奈瑟氏菌属、拟普雷沃菌属、梭杆菌属;（4）CAP组与CG组比较孪生球菌属相对丰度增高（P=0.022<0.05）,TM7Phylum sp.oral clone DR034、巨球菌属和弯曲菌属相对丰度降低（P=0.049<0.05、P=0.013<0.05、P=0.005<0.01）,差异有统计学意义,AST组与CG组相比纤毛菌属相对丰度降低（P=0.035<0.05）,差异有统计学意义。结论:（1）与健康儿童相比,呼吸道感染患儿口咽菌群部分优势菌属组成发生改变,CAP患儿孪生球菌属相对丰度增高,TM7 Phylum sp.oral clone DR034、巨球菌属和弯曲菌属相对丰度降低;AST患儿口腔中纤毛菌属相对丰度降低。（2）肺炎患儿口咽部菌群丰富度较健康儿童明显降低,而AST患儿口咽部菌群结构无明显变化,说明与上呼吸道感染相比,下呼吸道感染对口咽部微生态平衡的影响可能更大。
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