巴西橡胶树(Hevea brasiliensis Muell-Arg)属大戟科(Euphobiaceae)三叶橡胶树属(Hevea),高大乔木,典型的热带树种,所产天然橡胶是重要的战略物资,在国民经济中具有不可替代的作用。培育橡胶树优良品种是提高单位面积橡胶产量和促进产业发展的基础,长期以来的近缘杂交育种,造成橡胶树遗传基础日趋狭窄,新品种增产幅度不大。因此,目前的橡胶树育种急需拓宽新品种的遗传基础,提高育种效率,加快新品种的培育,而橡胶树种质材料的分类、保存、遗传分析是选育种的前提。AFLPi(扩增片断长度多态性)多态性强,谱带非常丰富且清晰可辨,试验结果稳定性、重复性好,是迄今为止最有效的分子标记之一。近年来,AFLP技术越来越多的用于林木资源的研究。本试验通过构建适合于巴西橡胶树叶片较稳定的AFLP银染体系,确定试验中需要的最佳反应条件,建立了188种巴西橡胶树种质的AFLP指纹图谱,分析其遗传多样性,为巴西橡胶树资源的分子评价和分子分类提供依据,为我国优良的天然橡胶资源的利用提供了科学依据,对橡胶种质资源研究和指导橡胶杂交育种有一定应用价值。主要研究结果如下：1.从256对EcoR I/Mse I引物组合中,筛选出25对谱带较清晰、多态性较高的引物组合,对188份橡胶树种质进行扩增分析,共扩增出1274条电泳谱带,其中701条为多态性带,多态性比率为55.02%。2.利用筛选出来的25对橡胶树AFLP引物组合对188份橡胶树种质材料采用UPGMA进行聚类分析,在遗传相似系数为0.584处可划分为3大类群,在遗传相似系数为0.74处,第三大类群可以细分为5个类群。5个类群在不同相似系数处再细分为若干个小组。进行了初步聚类及亲缘关系分析。3.供试的188份橡胶树种质材料的遗传相似系数最大的为0.9570815,最小的为0.5164521。大部分在0.84～0.94之间,占94.6%。说明大多数供试材料的遗传差异相对较小。4.构建了188份橡胶树种质的AFLP指纹图谱,其中12份橡胶树种质具有独特的特征带,根据指纹图谱可以区分开所有的供试橡胶树种质材料。5.对比聚类分析与系谱分析,两者获得的结果有一致性,印证了橡胶树AFLP指纹图谱的准确性、可靠性和实用性。指纹图谱可以对橡胶树种质的谱系进行研究,以完善橡胶树选育种数据库。6.虽然AFLP有不足之处,即较高的费用和操作技术难度,但AFLP具有稳定性好、重复性强、分辨率高等优点,用于橡胶树种质材料指纹图谱的构建具有一般分子标记所不可比拟的优势。