土地增值税清算是指负有土地增值税纳税义务的单位或个人在达到清算条件后,计算其应纳税款,并依法向主管税务部门提交纳税资料、填报申请表,结清税款的行为。近年来,随着我国房地产市场的火热发展,土地增值税作为房地产税的核心税种之一对房地产市场的调控作用显得尤为重要。因为我国针对房地产企业开发的房地产项目土地增值税的征收采取“先预征,后清算”的方式,这就决定了土地增值税税收源于两部分:一部分源自于房地产开发企业依法按预征比例预缴的土地增值税税款,另一部分则源于税务部门通过对房地产开发企业所开发的房地产项目进行土地增值税清算而需由其补缴的土地增值税税款。因为我国土地增值税预征率设置非常低,这就导致税务部门仅能从预征中征得少额税款,大部分土地增值税款的征收须通过土地增值税清算程序才能得以实现。然而我国土地增值税清算不管是在立法上还是实施中均存在诸多问题,致使大部分土地增值税清算并不彻底,从而导致国家税收大量流失的同时降低了土地增值税宏观调控价值的实现。以我国土地增值税清算法律制度的现状看,其还存在如下问题:一是土地增值税法律位阶低;二是土地增值税清算法律关系的主体制度不完善;三是土地增值税清算条件设置不合理;四是土地增值税清算程序规定不具体;五是土地增值税相关税率设置不合理;六是土地增值税清算执法现状有待改变;七是土地增值税清算法律监督规制不足。为此,应当从以下几个方面进行完善:一是提高土地增值税清算法律位阶;二是完善土地增值税清算法律关系的主体制度;三是推进土地增值税清算条件主动化;四是推动土地增值税清算程序具体化;五是适当调整土地增值税相关税率;六是改变土地增值税清算执法现状;七是加强土地增值税清算法律监督。