碳水化合物结合模块CBM92引入Thumb获得木聚糖酶活性的研究

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碳水化合物结合模块(CBM)拥有独立的折叠构象,促进酶与底物结合,但不具备催化活性。结构比对发现:来自海栖热袍菌Xyl10A的CBM9_2(C2)与黑曲霉木聚糖酶Xyn III(X)相似度很高,但缺乏必要的结构元件—Thumb结构。Thumb是GH11家族木聚糖酶特有的结构,序列保守性高,长度为11aa,对酶与底物的结合和水解有重要作用。本研究期望,在类活性中心突变(D169E、D177E)的基础上,于K136、T137之间引入X的Thumb(N118-F128),将结构模块C2改造成热稳定的、高催化活性的木聚糖酶。又考虑来源于中温酶的Thumb对于耐高温的C2而言可能“刚性”不足,进而依据高温酶的Thumb序列进行定点突变(E119Q、T123E、S126T),期望进一步提高突变体的稳定性。结果如下:(1)重组质粒的构建:使用反向PCR方法。以p ET20b-C2为模板,类活性中心突变得到:p ET20b-C7(D177E,实验室前期构建)、p ET20b-C9(D169E)、p ET20b-C79(D169E/D177E)。分别插入Thumb得到:p ET20b-CT、p ET20b-C7T、p ET20b-C9T、p ET21a-C79T。Thumb定点突变得到:p ET21a-C7T-9、p ET21a-C7T-3、p ET21a-C7T-6、p ET21a-C7T-93、p ET21a-C7T-96、p ET21a-C7T-36、p ET21a-C7T-936,共14个重组质粒。(2)浓缩后测纯蛋白活性:C2等15个粗蛋白均无活性,经Ni2+层析纯化后超滤浓缩100倍,测到突变体C7T对山毛榉木聚糖的降解活性。(3)最适p H(p Hopt):C7T的p Hopt为4.2,较野生型X(p Hopt 3.8)提高了0.4个单位。p H3.6-4.8范围内,相对残余酶活仍保留60%以上。(4)最适温度(Topt):C7T的Topt为48℃,较野生型X(Topt 46℃)提高了2℃。40℃相对残余酶活62%,51℃相对残余酶活69%。(5)半失活时间(t1/2):C7T在50℃下的t1/2为11.0 min,较野生型X(t1/219.8 min)缩短了8.8 min。(6)酶促动力学参数:1)Km值:1.2 mg·m L-1,低于野生型X(Km值为3.6 mg·m L-1),C7T与底物的亲和力较野生型提高3倍。2)Kcat值:1.4s-1,较野生型X(Kcat值为600 s-1)下降,C7T的催化活力较低。综上,本文通过类活性中心定点突变和引入Thumb结构,成功将结构域C2改造成有催化活性的木聚糖酶,且与野生型X相比,底物亲和力提高3倍,最适反应温度提高2℃。这种基于结构分析进行理性设计的改造策略,为酶分子改造提供了全新的科研思路。
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