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“紫草”类植物是我国传统的中药植物,其根部可以合成一类具有生物活性的功能化合物,即紫草素(shikonin)及其衍生物。然而,由于当前“紫草”类植物基因组信息的缺乏,我们在分子生物学与基因组学等方面对于它们的研究依然远远滞后于其他许多模式植物与作物;特别是目前还有许多紫草素生物合成相关的基因都不甚明了。因此,本研究以紫草(Lithospermum erythrorhizon)为材料,对其全基因组进行了从头测序、组装、注释以及初步分析,并且还进行了紫草不同组织转录组的测序与分析。本研究估计紫草基因组大