在传统的国际证券市场体系中，证券交易所处在一个自然垄断的地位。与此同时，国际证券市场体系又呈现高度分割的特征。全球化背景下跨境证券交易的出现和日益增长，不仅在宏观上改变着国际资本的流动，也在微观上影响着证券市场的结构，特别是作为证券市场组织者和市场中枢的证券交易所。本文就是按照理论和实践相结合的原则，运用现代国际经济学理论、金融市场微观结构理论和博弈论、信息经济学的原理，对跨境证券交易的制度设计和安排的系统梳理和分析；对资本市场全球化进程中，证券交易所这一中观层面市场组织者其演进趋势的分析。本论文以研究跨境证券交易的产生和发展为起点，重点探索了跨境证券交易的制度设计，涵盖了交易模式、最优清算原则和监管合作等主要环节，通过每一环节的探讨和设计，分析了跨境证券交易这一新变化对证券市场结构的影响。如何在交易所之间开展跨境证券交易?在经济全球化的过程中会不会出现单一的全球化证券交易所?最后，结合正在开放中的中国资本市场，提出了从规范跨境证券交易角度来促进我国证券市场结构完善的政策建议．全文共分七章，约12万字，大致归为三部分，第一部分为开篇的第一章导论和第二章，分析了在传统分割的市场结构下，跨境证券交易产生和飞速发展的客观必然性和相关因素，及其对以证券交易所为核心的证券市场结构带来的变革；第二部分包括第三章至第四章，是从理论到实践的对跨境证券交易相关的交易、结算机制的全面探讨和设计，提出了跨境证券交易的市场连接优化模式，检验了证券结算最佳模式在跨境情况下的兼容性；第三部分为第五章到第七章，主要是通过分析证券监管和合作中存在的“监管套利”现象，运用博弈论中的非对称信息博弈以及市场分割的理论和模型，提出了证券交易所全球化的制度基础条件，论证了跨境证券交易不会导致单一全球交易所的出现。并在此基础上，针对中国资本市场在开放进程中存在的股权分立、市场分割和投资资本外逃等结构性问题，从全面按照国际标准提升监管和公司治理水准，适度减少海外上市、采取全球同股同价发行、建立我国证券交易所跨境证券交易通道等方面提出了系统化的政策建议。