【摘 要】
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为了更好地在转录组水平研究疾病的发病机制,我们建立了cDNA基因芯片技术平台,现在已有12,630个克隆,已知基因有9,436个.在平台的质量上,片内和片间的信号强度的相关系数达到
【出 处】
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上海第二医科大学 上海交通大学医学院 上海交通大学
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为了更好地在转录组水平研究疾病的发病机制,我们建立了cDNA基因芯片技术平台,现在已有12,630个克隆,已知基因有9,436个.在平台的质量上,片内和片间的信号强度的相关系数达到0.95,且芯片的结果与实时定量RT-PCR的结果一致性好,说明我们的平台是稳定的可靠的平台.为了进一步研究维甲酸诱导分化的机制该文应用cDNA基因芯片技术,结合自组成图(SOM)与成分平面展示等生物信息手段,分析了药理浓度的ATRA诱导NB4细胞分化不同时相(6h、12h、24h、和48h)的基因表达谱.该文着重分析了C/EBP家族和bHLH家族的转录因子的变化情况,C/EBPα在ATPA作用后表达略微上升,随着向粒系终末分化表达发生了下降,而C/EBPβ和C/EBPε在ATPA作用后表达持续上升,它们变化的不同与这些C/EBP蛋白行使的功能不同相一致.综 上所述,在药理浓度ATRA作用下,APL细胞中的维甲酸受体通路重新被激活,许多基因的表达发生了变化,这些基因形成了一个复杂且有序的调控网络,最终使细胞走向分化.
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