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最早的microRNA（miRNA）基因发现于1993年。在经历了近十年的默默无闻之后，它被视为一类新的调控型RNA的创始成员。microRNA基因表达大约22个核苷酸RNA，可以调控含有反义互补序列的蛋白编码基因表达。microRNA参与生命过程中一系列的重要进程，包括早期发育，细胞增殖，脂肪代谢和细胞凋亡。人们对于miRNA调控基因表达的极大的兴趣推动了研究这些小RNA表达和运作的方法。动植物microRNA均由具有发夹结构的约70-90个核苷酸大小的单链RNA前体经Dicer酶加工后生成。相比于动物microRNA，植物microRNA的主要作为小干扰RNAs（siRNAs）引导破坏其mRNA靶标。寻找植物miRNA的研究和动物miRNA的相比，植物miRNA的作用方式决定了其与目标mRNA结合的程度——完全结合。虽然两者在特征提取方法上有着一定程度上的共同点，但植物miRNA在特征上的一些特点将两类miRNA预测分离开来。植物miRNA特征不如动物的那样复杂。对其进行预测，则需要借助具有更高精度的算法或者更为合适的模型来进行预测指导。植物miRNA的特征提取方法的核心影响因素，主要落在以下几个方面：（1）植物成熟miRNA的保守性；（2）可结合性位点；（3）植物miRNA前体的二级结构稳定性；（4）植物miRNA前体最小自由能的概率分布；（5）植物miRNA前体位点切除长度。针对上述特征提取方法，研究人员开发了一系列的植物miRNA预测工具。而这些预测工具通常是基于Smith-Waterman算法所搭建起来的，如PatScan、miRU、psRNATarget等。如果某些基因转录后得到的mRNA能够表达出毒蛋白，使得宿主（植物或者动物）获病，而它们可能也在不同程度的受到某些这种内源产生的小RNA的靶向作用,也就是说miRNA带来的收益将是可观的。对植物中的农作物而言，最明显的益处则是增产、抗倒伏、抗虫害等等。为了向相关科研工作人员提供便捷，本文对植物miRNA的寻找所对应的特征提取方法和相关软件进行了综述。根据对各个软件的学习，对植物miRNA预测有了很多认识，本文实现了3个碱基配对的特征，并能够对植物miRNA进行预测。