海关作为国家的进出境监督管理机构,肩负守卫国门安全的神圣职责,担负着对进出境货物及物品的监管、征税、缉私、统计等职能。党的十八届三中全会对海关监管管理体制进行了深化改革,习近平总书记明确提出要“贯彻总体安全观”,要求海关积极融入国家发展大局,保障国际物流通道顺畅有序,打造陆海内外联动、东西双向开放的全面开放新格局。随着国与国之间的经济和人员往来日渐密切,进出口贸易一路高歌猛进,海关的监管任务呈几何型增长。海关监管资源的配置愈发跟不上业务量增长的需求,这两者之间的矛盾由来已久,随着时间的推移矛盾越发深化尖锐,而这一矛盾在海关特殊监管区域体现尤为突出。海关特殊监管区域是按照国家要求,执行特殊经济政策的特定的区域,同时也是我国实现对外开放、实行创新制度和改革试点的重要区域。海关特殊监管区域一方面要满足企业充分享受优惠政策,快速通关的需要,增加企业的获得感,另一方面也要严格监管,守护区域经济和监管秩序。要平衡监管质量和监管效率,解决特殊区域业务量与监管资源不匹配的痼疾,引入风险管理的理念进行风险控制工作是一条可行之路。南通综合保税区是我国最早成立的海关特殊监管区域之一,笔者在南通综合保税区工作多年,对南通综合保税区内的业务模式和管理现状都十分熟悉,对风险控制工作中存在的问题和可以改进的地方也形成了自己的意见和看法。在本文中,笔者从风险管理理论出发,按照风险识别、风险分析、提出风险控制对策的思路展开研究,试图探讨南通综合保税区这一典型的海关特殊监管区域目前的风险控制现状及存在问题,针对问题和不足提出有针对性的改进建议。目前关于海关特殊监管区域风险控制问题的研究文献较少,海关特殊监管区域风险控制工作缺乏足够成熟的理论支持和实践指导。本文所探讨的南通综合保税区的改进模式希望能够为其他同类型海关特殊监管区域乃至全国海关特殊监管区域提供新的思路和可供借鉴之处。同时本文也对政府管理体制以及政策制订方面进行了积极探讨,具备一定的现实意义。