本试验采用了22个番茄材料，调查了它们的生物学性状和室内品质，运用CTAB法提取了材料的DNA，并对RAPD反应条件，各反应试剂浓度和琼脂糖浓度进行了优化，其主要结果如下：1．利用改良CTAB法提取了材料的DNA，其OD₂₆₀／OD₂₈₀比值在1.8～2.0之间，OD₂₆₀／OD₂₃₀大于2，而且电泳图谱清晰可见，所提取的DNA含有较少的杂质，符合RAPD的要求。2．采用正交试验设计的方法，建立了RAPD优化反应体系。所得最优体系为：25ml中含有模板DNA40ng，引物0.25μmol／L，dNTP200μmol／L，Tapase1.25U，10×PCRbuffer2.5μL，25m mol／LMgCl₂，1.5μL，ddH₂O14μL。适宜的扩增条件为94℃预变性5 min，94℃变性30s，36℃复性30s，72℃延伸1min，40个循环后，在72℃保持7分钟。3．琼脂糖浓度在1.6％和2.0％时都能将不同的DNA分开，而且电泳图谱清晰可见，本试验选用1.6％的琼脂糖浓度。4．从40个随机引物中筛选出11个多态性好的随机引物，用这11个引物对22个番茄材料进行扩增，11个引物共扩增出了74条DNA带，平均每个引物6.72条，其中61条具有多态性，占总条带数的82.4％，平均每个引物5.1条多态性带。5．对供试22个材料进行了聚类分析，亲缘关系分析，发现F1有偏向于父本遗传的趋势。对遗传距离和单果重、株高、可溶性固性物含量进行了相关性分析，结果表明均呈不显著相关。用RAPD遗传距离对杂种优势的预测有待进一步研究。