由于代谢系统在自然选择过程中的进化和分化,所以在特殊环境中生长的真菌更易产生结构多样的活性次级代谢产物。自然界中真菌菌株资源很丰富,其所独有的代谢途径产生了很多重要的药物先导化合物。在最近一个世纪对真菌次级代谢产物进行的系统研究中,学者们发现了大量具有不同生物学活性的小分子次级代谢产物。研究最为系统的是有药物开发潜力的化合物,其中包括具有抗细菌、抗真菌、抗寄生虫、抗病毒以及抗肿瘤等活性的物质。真菌次级代谢产物为创新药物开发提供了优质的化合物资源,同时其作为生物小分子探针对研究生物体正常的生物活动有重要意义。本研究旨在对国内一些特殊生长环境下真菌的化学物质进行系统的认知。本论文以中国青海玛沁县的冬虫夏草周边土壤菌Stagonospora trichophoricola和福建古田县的山茶厚皮香内生菌Phomopsis sp.两株真菌为研究对象,对其粗提物利用硅胶薄层层析、硅胶柱层析、凝胶柱层析和高效液相色谱等分离手段进行分离,共得到20个纯化合物,利用质谱、核磁共振等现代波谱技术测定其波谱数据,解析并鉴定了13个化合物,其中5个为新化合物。本研究对所有新化合物进行了抗菌活性与细胞毒活性评价。本论文从真菌S.trichophoricola的大米发酵乙酸乙酯提取物中,分离鉴定出7个化合物,分别为线肽类化合物trichopeptide A（1）和trichopeptide B（2）二酮哌嗪类化合物trichocyclodipeptidesA–C（3–5）,solerone（6）和13-hydroxy-14-oxocacalohastin（7）,其中1–5为新结构化合物。在抗菌活性筛选中,发现化合物3对真菌白色念珠菌有抑制作用,IC₅₀和MIC值分别为22和90μg/mL,化合物2和5对革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌有抑制作用,IC₅₀值分别为45和43μg/mL,化合物3和5对枯草芽孢杆菌有抑制作用,IC₅₀值分别为46和44μg/mL。本论文从真菌Phomopsis sp.的大米发酵乙酸乙酯提取物中分离鉴定出6个化合物,分别为convolvulopyrone（1）,isorhodoptilometrin（2）,mellein（3）,5-methylmellein（4）,11-hydroxy-4,6-dimethyl-2,4-dodecadienoic acid（5）,cytosporone C（6）。