目的：　　研究忍冬（Lonicera japonica Thunb.）、灰毡毛忍冬（Lonicera.macranthiodes Hand-Mazz.）、黄褐毛忍冬（Lonicerafulvotomentosa Hsu et S.C.Cheng.）、红腺忍冬(Lonicera.hypoglaucaMiq.)、华南忍冬（Lonicera.confusa DC.）等忍冬属药材5种基原植物的遗传多样性水平，并对其质量进行评价。　　方法：　　1.采用ISSR和SRAP分子标记技术检测忍冬、灰毡毛忍冬、黄褐毛忍冬、红腺忍冬、华南忍冬等忍冬属药材5种基原植物的遗传多样性水平，得到DNA指纹图谱。利用NTSYS软件处理数据，UPGMA构建聚类图;Mantel检测法对两种标记进行相关性检验。　　2.用Primer Premier5.0软件设计引物，PCR扩增5种植物样本的rbcL基因片段，ClustalX1.83软件对所得序列进行全比对，MEGA4.0软件分析各样本rbcL序列特征。　　3.以绿原酸、木犀草苷等有效成分为研究对象，应用METLC法对忍冬属药材进行鉴别研究。固定相采用聚酰胺薄膜，展开剂选用SDS-正丁醇-正庚烷-水组成的微乳液，使用CAMAG薄层色谱分析仪对数据及图像进行处理，并构建METLC指纹图谱。　　4.HPLC检测有效成分含量:使用Kromasil C18色谱柱（4.6mm×250 mm，5μ m），以1％冰醋酸-乙腈为流动相，采用梯度洗脱法，使用DAD检测器在350 nm波长处检测绿原酸、木犀草苷的有效成分含量，并以此成分为研究对象构建HPLC指纹图谱。　　结果：　　1.实验筛选的16条ISSR引物和22对SRAP引物分别扩增出232、215条条带，多态性条带分别占到201、154条，得到的DNA指纹图谱可清晰区别5种植物;UPGMA将5种忍冬属植物聚为A、B两大类，A类为金银花基原植物，B类为山银花基原植物，B类中，黄褐毛忍冬单独聚为一支，其余种聚为一支;两种标记技术相关系数(r)为0.9703，呈显著正相关性。　　2.5种忍冬属药用植物rbcL基因序列长度在1143～1167 bp之间，手工校正后长度为1137 bp，保守位点1126个，变异位点11个，简约信息位点6个;红腺忍冬、灰毡毛忍冬和华南忍冬之间碱基序列几乎相同，这三者与忍冬之间变异碱基有9个，与黄褐毛忍冬之间变异碱基有8个，忍冬与黄褐毛忍冬间变异碱基有5个。　　3.METLC实验确定出以含水量为75％的微乳液(SDS-正丁醇-正庚烷-水=6.7∶15.8∶2.5∶75)-甲酸=9∶1为最佳展开剂，得到的斑点清晰、分离度好，数量多达12个，能有效的鉴别各药材;以绿原酸和木犀草苷有效成分构建的METLC指纹图谱可反应金银花药材与山银花药材在化学成分上的差异，并可区别山银花药材4种基原植物间化学成分的异同，5个样品生成的指纹图谱共有6条共有峰。　　4.经HPLC-DAD检测，各样品有效成分含量均达到《中国药典》规定标准，木犀草苷成分仅在金银花中检测出，绿原酸在金银花和山银花中均存在，其含量在灰毡毛忍冬中最高，在华南忍冬中最少;HPLC指纹图谱共产生5个共有峰，从各样品非共有峰可区别金银花和山银花药材之间以及山银花药材4种基原植物间化学成分的差异。　　结论：　　ISSR和SRAP两种分子标记有效揭示了忍冬属药材5种基原植物的多样性水平，两种标记形成的UPGMA聚类结果显示，金银花药材基原植物忍冬与山银花药材的4种基原植物遗传关系较远，两类药材在基因水平上存在一定差异。　　5种植物的rbcL基因序列差异显示，金银花基原植物与山银花基原植物间rbcL碱基序列存在差异，山银花基原植物中黄褐毛忍冬与其余三个种差异较为明显，以上结果与ISSR和SRAP分子标记中聚类结果一致。　　METLC技术相比传统TLC技术更加简便、快速、经济，能有效鉴别金银花药材和山银花药材，并有效区别山银花的4种基原植物，能够应用于金银花和山银花药材的质量控制。　　本课题综合从分子水平以及化学成分水平上对忍冬属药材的5种基原植物进行了系统科学的研究，为忍冬属药材的品种改良以及质量控制提供了一定理论依据。构建的DNA指纹图谱以及METLC、HPLC化学指纹图谱，使得中药材的质量从遗传物质到以有效成分为主的化学物质有了一个系统的评价，为金银花、山银花这种多基原药材的合理开发利用提供了重要信息。