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本研究从长江中下游主要湖泊(鄱阳湖、巢湖、太湖、洞庭湖、梁子湖以及保安湖)采集到的寄生于淡水贝类中的8种蚌螨和1种自由生活的水螨,测定了样品(共29个)的线粒体DNA(mtDNA)12S rRNA基因部分序列;通过对蚌螨12S rRNA基因序列的分析和系统发育以及种群结构的研究。结果表明:蚌螨的12S rRNA基因富含A、T;以自由生活的盔皱喙水螨为外群重构蚌螨系统发育树,所有的系统发育树的拓扑结构均很相似;所分析的蚌螨均能很好的在系统发育树分开来,并具有很高的置信度,说明线粒体12S rRNA基因适合于蚌螨属内关系的系统发育分析;弯弓蚌螨作为相对进化的种位于系统发育树的最前端,离外群位置最远,而今村蚌螨在树的根部与外群距离最近,则为相对原始种;台湾蚌螨与Y纹蚌螨聚为一大支,支持传统的将这两个种划分为同一亚属的观点。 通过对弯弓蚌螨种群的分析,发现寄生于不同宿主的弯弓蚌螨核苷酸分化系数Nst(0.94721,0.97504,0.99000)均很高,说明不同宿主内的弯弓蚌螨之间遗传差异很大;固定系数Fst(0.94488,0.97333,0.98930)均很大,说明各亚群之间的遗传分化程度很高;而且基因流指数Nst(0.003,0.007,0.015)均小于0.5,说明造成各亚群差异的主要原因为遗传漂变。