猪miR-155两种基因型的性状关联分析的研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:linco87
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微小RNA(microRNA)是非编码RNA中最为人们熟悉的一个亚类,它广泛的参与发育,细胞凋亡和细胞增值。miR-155在免疫系统发生发育及调控中扮演重要角色,其宿主基因上关键位点的突变可能导致miR-155表达量的改变,从而引起下游免疫系统的差异。我们根据miR-155宿主基因BIC(B-cell Integration Cluster)上的SNP信息,利用PCR-RFLP方法在中外培育品种猪中鉴定了两种基因型个体,利用流式细胞术分选调节性T细胞(Regulatory T cell,Treg)以进行后续基因表达差异试验验证,同时统计分析了其中一个关键SNP的基因型与杜洛克×二花脸F2资源群体的免疫指标关联性,具体结果如下:(1)不同猪种两种基因型个体的鉴定在miR-155宿主基因BIC上,我们将miR-155前体的第一个碱基以+1表示,上游305bp的A/C突变以-305bp表示,我们根据-305A/C这个SNP信息,在三个中外培育品种中寻找两种基因型个体。通过对55头苏钟猪、300鄂通两头乌和250头湖北白猪进行PCR-RFLP分析,在鄂通两头乌中挑选得到4头AA型个体和3头CC型个体,在湖北白猪中挑选到2头AA型个体和2头CC型个体。在鄂通两头乌群体中,AA基因型频率为0.0348,AC基因型频率为0.4609,CC基因型频率为0.5043。A的基因频率为0.2653,C的基因频率为0.7347。在湖北白猪群体中,AA基因型频率为0.8279,AC基因型频率为0.1680,CC基因型频率为0.0041。A的基因频率为0.9119,C的基因频率为0.0881。在检测的55头苏钟猪中,没有发现CC型。AA基因型频率为0.6545,AC基因型频率为0.3455。A的基因频率为0.8273,C的基因频率为0.1727。(2)两种基因型猪血常规性状差异分析利用Beckman Coulter Ac.Tdiff 2血细胞分析仪对两种基因型的鄂通两头乌进行血常规检测,将4头AA基因型个体和3头CC基因型个体的血液指标进行T检验分析。结果发现:两种基因型猪间,红细胞平均体量(MCV,f L)存在差异(P<0.05),红细胞体积分布宽度(RDW,%)存在显著差异(P<0.01)。(3)MiR-155上游305A/C突变与F2群体一些免疫指标的关联分析根据miR-155上游305bp的A/C突变对杜洛克×二花脸F2资源群体共计394头个体进行分型,并在不同时间点与该群体的免疫指标进行关联分析。结果表明:在F2群体中,AA基因型频率为0.2507,AC基因型频率为0.5171,CC基因型频率为0.2321。A的基因频率为0.5092,C的基因频率为0.4908。在20日龄时,miR-155前体上游305A/C突变对CD4-CD8+CD3-,CD4-CD8+CD3+细胞有显著影响(P<0.05)。在33日龄时,mi R-155前体上游305 A/C变异对红细胞数(RBC)、红细胞比容(HCT)和血红蛋白含量(HGB)有显著影响(p<0.05),对血小板体积分布宽度(PDW)和血小板平均体积(MPV)有极显著影响(p<0.01)。在35日龄时,该SNP对血红蛋白含量(HGB)、红细胞比容(HCT)有显著影响(p<0.05),对血小板体积分布宽度(PDW)有极显著影响(p<0.01)。在80日龄时,对嗜酸性粒细胞数(EO),嗜酸性粒细胞比率(EOP)有显著影响(p<0.05)。该位点可能影响miR-155的表达,从而在个体生长的不同时间点,调控不同的通路,影响不同类型的免疫细胞的发育。(4)两种基因型猪的Treg细胞分选利用流式细胞仪和三种不同荧光标记的抗体分选不同基因型猪的Treg。先根据总白细胞中不同细胞的物理参数(大小,浓度等)的不同分选出淋巴细胞,设置一个门,再从这个门中分选出CD3+的细胞类群,再从中选取CD4+细胞,最后再从CD4+T细胞中选择CD25+细胞,最终得到Treg细胞,流式细胞分析结果表明猪Treg细胞占总白细胞的1%左右。(5)体外实验验证miR-155对其靶基因的作用通过转染mimic155到猪的巨噬细胞中,发现了miR-155对四种靶基因的mRNA表达水平的影响不显著。本研究初步证明了miR-155宿主基因BIC上的SNP突变与一些免疫指标存在关联。miR-155对其靶基因的作用可能是转录后水平。该研究为揭示两种基因型猪之间的免疫能力差异提供了理论依据,同时为猪相关性状分子育种提供了新的分子标记。
其他文献
本实验以比利时兔、天府黑兔、齐卡兔、哈白兔及加利福尼亚兔5个品种共220个个体为试验材料,采用PCR—SSCP方法检测生长激素基因(GH)的多态性,并分析其与生产性能的相关性。