服饰皮革材料热稳定性的分子动力学模拟研究

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天然皮革的热稳定性是皮革服饰服用性能中的一项重要指标。在对已有的文献进行查阅之后,发现现阶段对于皮革热稳定性性能的研究大多基于宏观实验的研究方法,而对于皮革热稳定性微观层面的研究资料很少。本文从微观层面出发,采用分子动力学模拟的研究方法,对天然皮革中I型胶原蛋白分子的内在结构进行实验设计与分析,其中包括天然皮革分子模型的建立以及对皮革蛋白质大分子动力学模拟后所得轨迹进行构想分析,得到一定条件下的天然皮革热稳定性能在微观层面的表现及其与胶原蛋白分子内在空间构象之间的一种关系。首先从PDB中下载天然皮革中基本物质编号为1cgd的I型胶原蛋白通过AMBER11软件对1cgd这种I型胶原蛋白在AMBER ff99SB力场,自由边界条件和正则系综(NPT)的条件下,分别在298K,338K,378K和418K四个依次递增的温度下进行时间为40纳秒的分子动力学模拟,时间步长为1飞秒,建立1cgd I型胶原蛋白这四个温度下的分子模型。然后通过均方根偏差、回转半径、接触数这三个参数以及采用VMD软件截取在不同温度条件下不同时刻的构象图,再对在不同温度设定下模拟所得轨迹进行分析,从而得出随着温度的变化I型胶原蛋白分子的空间构象所发生的变化:随着温度从298K上升至418K,胶原蛋白的稳定性下降及空间构象偏离天然构象的程度随之增大,分子结构逐渐呈现出向内弯曲的状态,且分子两端的基团逐步呈现分离状态;I型胶原蛋白分子的回转半径从298K温度条件下的25.9?至418K温度条件下的25?,表明回转半径随温度的上升越来越小及表示分子结构随着温度的上升而变得紧密;接触数从298K条件下的780至418K条件下的690表示接触数随着温度的升高越来越少,这也意味着蛋白质分子的结构稳定性随着温度的升高而降低。
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